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| RAPPORT FINANCIER SEMESTRIEL |
INFORMATION REGLEMENTEE
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RAPPORT FINANCIER SEMESTRIEL
Période du 1er janvier 2025 au 30 juin 2025 30 septembre 2025 SOMMAIRE Page I. Rapport semestriel d’activité 3 Informations relatives à l’entreprise 4 Évènements significatifs durant le semestre écoulé (du 1er janvier 2025 au 30 juin 2025) 4 Activité de la Société au 1er semestre 2025 5 Perspectives d’avenir 6 Principaux risques et incertitudes 7 Principales transactions avec les parties liées 7 Liquidité et sources de financement 7 II. Comptes consolidés résumés 11 Etat consolidé de la situation financière 13 Compte de résultat consolidé 14 Etat consolidé du résultat global 15 Etat de variation des capitaux propres consolidés 16 Etat de flux de trésorerie consolidés 17 Annexes aux états financiers consolidés au 30 juin 2025 18 III. Attestation du responsable du rapport financier semestriel 52 IV. Rapport des commissaires aux comptes sur l’information financière semestrielle 54 Page 2 I. Rapport semestriel d’activité Page 3 1. Informations relatives à l’entreprise Nanobiotix, Société Anonyme immatriculée au registre du commerce et des sociétés de Paris sous le numéro 447 521 600 et ayant son siège social au 60 rue de Wattignies, 75012, Paris (« Nanobiotix » ou la « Société » et, avec ses filiales, le « Groupe »), est une société de biotechnologie au stade clinique et en phase avancée, pionnière dans les approches thérapeutiques novatrices fondées sur les nanoparticules pour le traitement du cancer et d’autres besoins médicaux importants avec l’intention expresse d’avoir un impact favorable sur la vie de millions de patients. Créée en 2003, Nanobiotix a son siège social à Paris, France. La Société possède également des filiales à Cambridge, Massachusetts (États-Unis), en Espagne et en Allemagne. Le Groupe est coté sur Euronext : Paris sous le symbole « NANO » depuis 2012 (ISIN : FR0011341205, Code Bloomberg : NANO:FP) et sur le Nasdaq Global Select Market sous le symbole « NBTX » aux États-Unis depuis décembre 2020. Le Groupe est propriétaire de plus de 25 familles de brevets associés à trois plateformes nanotechnologiques : 1) la plateforme de radioenhancers dont JNJ-1900 (NBTXR3) est le premier produit candidat conçu pour détruire localement les cellules tumorales et activer une réponse immunitaire de manière systémique ; (2) la plateforme de nanoprimers Curadigm conçue pour redéfinir la conception et l’application de classes thérapeutiques confrontées à l’élimination hépatique ; et (3) OOcuity pour les maladies neurologiques. La Société concentre ses efforts sur le développement de JNJ-1900 (NBTXR3). 2. Évènements significatifs durant le semestre écoulé (du 1er janvier 2025 au 30 juin 2025) Le développement clinique mené au premier semestre 2025 s’est principalement axé sur l’établissement d’un socle thérapeutique pour JNJ-1900 (NBTXR3) dans le carcinome épidermoïde de la tête et du cou (CETEC) et dans le cancer du poumon non à petites cellules (CPNPC), tous deux définis comme des priorités stratégiques. Dans les deux indications, la radiothérapie demeure une pierre angulaire de la prise en charge des patients, offrant un cadre rationnel pour l’intégration d’un radioenhancer administré localement tel que JNJ-1900 (NBTXR3). Dans le cancer de la tête et du cou, l’attention s’est portée sur l’essai de Phase 3 en cours NANORAY-312, dont le transfert de sponsorship à Janssen Pharmaceutica NV, une société Johnson & Johnson (« J&J »), est en voie d’achèvement. En parallèle, Nanobiotix a renforcé sa position financière grâce à un amendement de l’accord de licence conclu avec J&J, apportant un soutien additionnel à l’avancement de l’essai de Phase 3 NANORAY-312. L’expansion vers d’autres types de tumeurs où la radiothérapie seule ou en association avec une immunothérapie fait partie du standard de soin est également en cours. Ces deux essais ont fourni des preuves d’activité antitumorale tout en confirmant le profil de sécurité de JNJ-1900 (NBTXR3), notamment dans le cadre d’une ré- irradiation chez des patients atteints d’un CPNPC et chez des patients atteints d’un cancer du pancréas localement avancé ou à la limite de résécabilité, comme rapporté au premier semestre 2025. Cancer du poumon (CPNPC) : premier essai randomisé dans le poumon Grâce à notre collaboration avec J&J, le CPNPC est devenu un autre axe clé de développement aux côtés du CETEC. Au premier trimestre 2025, J&J a traité le premier patient dans CONVERGE, un essai mondial de Phase 2 randomisé évaluant JNJ-1900 (NBTXR3) activé par radiothérapie chez des patients atteints de CPNPC de stade III non résécable recevant la chimioradiothérapie standard suivie de durvalumab en consolidation. Cet essai représente la première étude randomisée de JNJ-1900 (NBTXR3) dans le cancer du poumon. Si les résultats sont positifs, conformément au protocole, cet essai pourrait constituer une étape majeure dans l’expansion du portefeuille de développement dans le cadre de l’accord de licence Nanobiotix–Janssen. Cancer du poumon (CPNPC) : premiers résultats de Phase 1 Par ailleurs, les résultats de la partie escalade de dose complétée d’un essai de Phase 1 (Étude 2020-0123), mené par le MD Anderson Cancer Center de l’Université du Texas, ont été présentés lors de la Conférence européenne sur le cancer du poumon (ELCC) 2025. Cette étude évalue JNJ-1900 (NBTXR3) chez des patients atteints de CPNPC récidivant au niveau locorégional, ayant reçu une radiothérapie antérieure, et inopérables, explorant ainsi l’opportunité d’une utilisation de JNJ-1900 (NBTXR3) en situation de ré-irradiation. Douze patients ont été évalués pour la sécurité, la faisabilité ainsi que pour l’analyse préliminaire de données de survie : • Aucune toxicité limitant la dose liée à JNJ-1900 (NBTXR3) et aucun effet indésirable de grade 3 ou supérieur lié à JNJ-1900 (NBTXR3) n’ont été rapportés ; • Des premiers signes d’efficacité prometteurs ont été observés : une analyse préliminaire des données de survie a montré une LPFS (local progression-free survival, survie sans progression locale) à 12 mois de 64 % (médiane de 18,6 mois) et une OS (overall survival, survie globale) à 12 mois de 83 % (médiane de 30,2 mois). Page 4 Ces résultats soutiennent la faisabilité et le potentiel thérapeutique de l’utilisation de JNJ-1900 (NBTXR3) en situation de ré-irradiation, qui concerne une population de patients disposant de très peu d’options thérapeutiques efficaces. La partie expansion de l’étude est en cours. Cancer du pancréas : données de Phase 1 finales et expansion de l’étude En mai 2025, Nanobiotix a présenté les données finales de son essai de Phase 1 évaluant JNJ-1900 (NBTXR3) chez des patients atteints de cancer du pancréas localement avancé ou à la limite de résacabilité, une population caractérisée par un fort besoin médical non satisfait. L’étude a démontré, chez 22 patients : • une survie globale médiane (mOS) de 23,0 mois contre 19,2 mois dans des données historiques1 ; • une survie sans progression locale médiane (mLPFS) de 13,3 mois ; • une normalisation du CA19-9 chez 59 % des patients ; • deux patients atteints de cancer du pancréas localement avancé ont bénéficié d’une résection chirurgicale R0. Ces résultats suggèrent que JNJ-1900 (NBTXR3) activé par radiothérapie, après une chimiothérapie d’induction, pourrait renforcer le contrôle tumoral local et améliorer la probabilité d’une résection chirurgicale réussie. Une cohorte d’expansion combinant JNJ-1900 (NBTXR3) avec la chimioradiothérapie standard, après chimiothérapie d’induction, a été initiée au premier semestre 2025. Amendement de l’accord de licence avec J&J En mars 2025, Nanobiotix et J&J ont signé un amendement à l’accord de licence transférant à J&J la quasi- intégralité de la responsabilité financière de NANORAY-312, l’essai mondial de Phase 3 en cours évaluant JNJ-1900 (NBTXR3) dans le cancer de la tête et du cou localement avancé, précédemment assumée par Nanobiotix, moins une petite partie des coûts qui resteront à la charge de Nanobiotix. Nanobiotix continuera de soutenir l’exécution de NANORAY-312 pendant et après le transfert de sponsorship. Certaines obligations de potentiels futurs paiements d’étape, sélectionnées et limitées, précédemment dues par J&J à Nanobiotix, ont été réduites dans le cadre de cet amendement. 3. Activité de la Société au 1er semestre 2025 3.1 PRODUITS DES ACTIVITÉS ORDINAIRES Le total du chiffre d’affaires et autres produits d’exploitation pour le semestre clos le 30 juin 2025 s'élève à 26,6 millions d'euros, contre 9,3 million d'euros pour le semestre clos le 30 juin 2024, principalement en raison du chiffre d'affaires comptabilisé dans le cadre de la modification contractuelle avec Janssen. Au 30 juin 2025, le chiffre d'affaires total a atteint 24,9 millions d'euros, composé des éléments suivants : • Revenus de “Services” incluant (i) un produit ponctuel de 21,2 millions d'euros directement attribuable à l'impact de la modification contractuelle ayant eu lieu sur le semestre clos le 30 juin 2025, venant compenser l'impact du chiffre d’affaire négatif constaté sur l'exercice 2024: les avenants signés au cours du dernier trimestre 2024 avaient significativement réduit le prix de transaction du contrat de licence, car l’obligation de performance de service R&D avait été remplacée par une obligation de financement de la Société vis-à-vis de Janssen, alors que l'avenant signé en mars 2025 n'a pas modifié le périmètre des obligations de performance de la Société, mais a augmenté le prix de transaction restant de l’accord global de licence, (ii) et d'autres produits de services liés à la refacturation du transfert de technologie et d'assistance technique à Janssen pour un montant de 0,4 million d'euros. • “Autres ventes” s’élevant à 3,4 millions d'euros liés aux fournitures cliniques de produits à Janssen pour le semestre clos le 30 juin 2025. Pour le semestre clos le 30 juin 2024, le chiffre d’affaires de la Société de 6,2 millions d'euros comprend principalement (i) le chiffre d'affaires «Services» lié au transfert de la licence à Janssen et aux services de R&D rendus au prorata de l'achèvement des études en cours, pour un montant total de 2,7 millions d'euros ; (ii) le revenu de “Services” lié à la refacturation du transfert de technologie et d'assistance technique pour 1,1 million d’euros ; (iii) et le montant de 2,4 million d'euros d'« Autres ventes » liées à l’approvisionnement en produits cliniques à Janssen. Le total des autres produits s'élève à 1,7 million d'euros pour la période close le 30 juin 2025 contre 3,1 millions d'euros pour la période close le 30 juin 2024, la diminution de 1,4 million d'euros étant principalement liée (i) au crédit d'impôt recherche pour 1,6 million d'euros, contre 2,3 millions d'euros pour la période close le 30 juin 2024, principalement en raison de l'exclusion d'un fournisseur majeur du périmètre du CIR et (ii) à la refacturation de services dans le cadre de l'accord de collaboration d’essai global (ou « GTCA ») pour un montant total de 26 milliers d'euros contre 0,5 million d'euros pour la même période de l'exercice précédent. 1Des données historiques, issues du MD Anderson, portant sur 144 patients patients atteints de cancer du pancréas localement avancé et traités dans un centre identique ont montré une survie globale médiane de 19,2 mois. Ces patients ont reçu une chimiothérapie d’induction suivie d’une radiothérapie, avec ou sans chimiothérapie concomitante ou d’entretien (80 % ayant reçu une chimio-radiothérapie concomitante). Page 5 Pour plus de détails voir la Note 16 - Produits des activités ordinaires des états financiers consolidés intermédiaires résumés non audités inclus dans ce rapport. Le détail du chiffre d’affaires et autres produits d’exploitation est présenté dans le tableau ci-dessous : (en milliers d'euros) 30 juin 2025 30 juin 2024 Services 21 522 3 787 Autres ventes 3 406 2 376 Total Chiffre d’affaires 24 928 6 163 Crédit d’impôt recherche 1 616 2 334 Subventions 67 36 Autres produits 26 756 Total Autres produits d’exploitation 1 710 3 126 Total Chiffre d’affaires et Autres produits d’exploitation 26 638 9 289 3.2 CHARGES OPÉRATIONNELLES Les charges opérationnelles du 1er semestre 2025 s’élèvent à 25,8 millions d’euros contre 32,9 millions d’euros au premier semestre 2024. Le poids relatif des dépenses en R&D par rapport aux frais généraux en pourcentage par rapport au total des charges d’exploitation, a augmenté et se situe respectivement à 56 % et à 44 % des dépenses engagées au titre du premier semestre 2025, par rapport à respectivement 67 % et 33 % au premier semestre 2024. Au cours du premier semestre 2025, la diminution de 7,5 million d'euros des activités de recherche et développement est principalement liée à une diminution de 7,7 millions d'euros des achats, sous-traitance et autres dépenses reflétant le transfert du sponsorship de l'étude 312 à Janssen, y compris la modification de l'Accord Janssen signé en mars 2025, entraînant la suppression de l’obligation de financement sur l'étude 312, partiellement compensée par l'augmentation de 0,2 million d'euros des coûts de la masse salariale en R&D. Les frais généraux et commerciaux (SG&A) ont légèrement augmenté de 0,5 million d'euros, atteignant 11,3 millions d'euros pour le premier semestre 2025 contre 10,8 millions d'euros pour le premier semestre 2024. Ceci est dû à une augmentation des charges salariales SG&A de 0,7 million d'euros liée aux charges sociales liées à l'attribution d'options d'achat d'actions intervenue en juin 2025 (contre juillet 2024), qui est partiellement compensée par une diminution de 0,4 million d'euros liée au règlement de provisions pour litiges. (en milliers d'euros) S1-2025 Poids relatif S1-2024 Poids relatif Recherche & Développement 14 529 56 % 21 987 67 % Frais généraux et commerciaux 11 294 44 % 10 819 33 % Autres produits et charges opérationnels 7 —% 134 —% Total des charges opérationnelles 25 829 100 % 32 940 100 % 3.3 RÉSULTATS Le résultat d’exploitation s’établit à un gain de 0,8 millions d’euros pour le semestre clos le 30 juin 2025 contre une perte de 23,7 millions d’euros pour la même période en 2024. Le résultat d'exploitation comprend les produits et autres revenus et les charges d'exploitation (voir section II Notes 16 - Produits des activités ordinaires et 17 - Charges opérationnelles des états financiers consolidés résumés intermédiaires non audités inclus dans le présent rapport). Le résultat financier s’établit à une perte de 6,2 millions d’euros pour le semestre clos le 30 juin 2025 contre une perte de 1,9 millions d’euros pour la même période en 2024 (voir Section II Note 19 - Résultat financier net des états financiers consolidés résumés intermédiaires non audités inclus dans le présent rapport). Le résultat net semestriel s’établit à une perte de 5,4 millions d’euros pour le semestre clos le 30 juin 2025 contre une perte de 21,9 millions d’euros pour la même période en 2024. 4. Perspectives d’avenir Page 6 Nanobiotix développe trois plateformes nanotechnologiques. Le premier candidat thérapeutique de la première plateforme, le radioenhancer potentiel first-in-class JNJ-1900 (NBTXR3), est en cours de développement clinique dans l’optique d’une potentielle commercialisation par J&J. Nanobiotix projette d’utiliser les potentiels revenus du développement et de la commercialisation de JNJ-1900 (NBTXR3) sous réserve d’atteinte de certaines étapes de développement et d’obtention de l’autorisation de commercialisation, pour financer le développement de ses deux autres plateformes Curadigm et Oocuity. L’accord de licence global entre Nanobiotix et J&J a établi un cadre pour un co-développement potentiel et complémentaire d’indications considérée comme pertinentes à court, moyen et long terme. Ce cadre inclut la possibilité pour Nanobiotix, sous réserve d’une approbation de J&J, de mener des études de Phase 2 randomisée avec JNJ-1900 (NBTXR3). Le Joint Strategic Committee (organisme se prononçant sur le développement clinique) déterminera en fin de compte les prochaines indications au-delà des priorités opérationnelles immédiates du CETEC-LA et du CPNPC de stade 3. Nanobiotix au-delà de la collaboration JNJ-1900 (NBTXR3) Alors que le programme JNJ-1900 (NBTXR3) progresse vers l’objectif ultime d’améliorer de manière significative les résultats pour les patients atteints de cancer dans le monde entier grâce à l’exécution de NANORAY-312, menée par J&J depuis le 1er janvier 2025. Nanobiotix prévoit d’élargir l’impact de ces thérapies à base de nanoparticules dans le domaine de la santé grâce au développement de Curadigm et Oocuity. La plateforme Curadigm a rendu possible la découverte d’un « nanoprimer » conçu pour occuper temporairement les cellules hépatiques chargées d’éliminer les produits thérapeutiques. Ce mécanisme vise à préparer l’organisme pour augmenter la biodisponibilité de produits thérapeutiques dans le sang et en conséquence leur accumulation dans les tissues cibles ; permettant ainsi potentiellement d’augmenter l’efficacité ou de réduire la toxicité de traitements injectés par voie intraveineuse (IV). La plateforme Oocuity repose sur l’idée que les propriétés électriques des matériaux nanoparticulaires leur permettent d’interagir avec les réseaux neuronaux et de les influencer. Cette propriété pourrait permettre de moduler les réseaux neuronaux défectueux vers un état « normal », par exemple, en réduisant l’hyperexcitabilité neuronale associée à la douleur neuropathique. 5. Principaux risques et incertitudes Les estimations de la direction de la Société sont basées sur des informations provenant d’analystes indépendants du secteur et de sources tierces, ainsi que de données issues de recherches internes, et reposent sur des hypothèses formulées par la direction sur la base de ces données et de sa connaissance du secteur et du marché, que la direction estime raisonnables. En outre, bien que la direction estime que les informations sur les opportunités de marché incluses dans le présent rapport semestriel sont généralement fiables et reposent sur des hypothèses raisonnables, ces données et les activités de la Société comportent des risques et des incertitudes auxquels la Société pourrait être confrontée au cours des six mois restants de l’exercice. Ces principaux risques et incertitudes sont identiques à ceux présentés dans la section 1.5 du document de référence universel de la Société déposé auprès de l’Autorité des marchés financiers (AMF) le 2 avril 2025 (“URD 2024”) pour l’exercice clos le 31 décembre 2024 (copie de l’'URD 2024 disponible sur le site Internet de la Société (www.nanobiotix.com)). 6. Principales transactions avec les parties liées La rémunération des membres du directoire et du conseil de surveillance a été mise en œuvre au cours de ce premier semestre 2025 conformément à la législation applicable en matière de gouvernance d'entreprise (voir Section II Note 23 - Parties liées aux états financiers consolidés résumés intermédiaires non audités inclus dans ce rapport) sans changement significatif par rapport aux conditions de l'exercice clos le 31 décembre 2024. Ces transactions avec des parties liées conclues au cours de l'exercice clos le 31 décembre 2024 sont mentionnées dans la Note 23 - Parties liées des états financiers consolidés de l'exercice clos le 31 décembre 2024. Page 7 7. Liquidités et ressources en capital 7.1 Introduction Au cours du semestre clos 30 juin 2025, nos activités se sont concentrées sur les besoins de notre organisation, liés aux coûts de fabrication, de financement et de mise en conformité, au développement commercial et au maintien de notre portefeuille de propriété intellectuelle, et à la réalisation d'études précliniques et d'essais cliniques. Depuis notre création, nous avons toujours généré des flux de trésorerie d'exploitation négatifs et avons financé nos opérations et notre croissance principalement par des augmentations de capital successives, des émissions de dette, des accords de collaboration et de licence, ainsi que par le remboursement des créances liées au Crédit d'Impôt Recherche (CIR). Les actions ordinaires de Nanobiotix sont négociées sur le marché Euronext Growth d'Euronext à Paris depuis le 10 septembre 2012, et les ADS sont négociées sur le Nasdaq Global Market à New York depuis le 20 décembre 2020. Pour plus d'informations sur ces accords de financement, voir ci-dessous la Section II. Note 13 - Passifs financiers des états financiers consolidés résumés intermédiaires non audités inclus dans le présent rapport. 7.2 Variation des flux de trésorerie Le tableau ci-dessous résume les entrées et sorties de trésorerie de la Société pour les semestres clos les 30 juin 2025 et 2024 : (en milliers d’euros) 30 juin 2025 30 juin 2024 Flux nets de trésorerie liés aux activités opérationnelles (17 411) (5 836) Flux nets de trésorerie liés aux activités d'investissement (162) (500) Flux net de trésorerie liés aux activités de financement (2 830) (2 655) Incidence de la variation des taux de change (515) 43 Variation de trésorerie (20 919) (8 948) Flux de trésorerie liés aux activités d'exploitation Nos flux nets de trésorerie liés aux activités d'exploitation se sont élevés à 17,4 millions d'euros et 5,8 millions d'euros pour les semestres clos les 30 juin 2025 et 2024, respectivement. La variation défavorable des flux nets de trésorerie liés aux activités opérationnelles s’élevant à -11,6 millions d'euros est principalement due : (i) à un impact net défavorable de -15,2 millions d'euros lié à la diminution des paiements reçus de la part de Janssen sur le premier semestre 2025 par rapport à la même période en 2024. En effet, au cours du premier semestre 2024, le Groupe a perçu le premier paiement d'étape de 18,6 millions d'euros de la part de Janssen, ce qui se traduit par un effet négatif de -18,6 millions d'euros, partiellement compensé par une augmentation de +3,4 millions d'euros des encaissements sur les autres revenus de Janssen entre le premier semestre 2025 et le premier semestre 2024. (ii) partiellement compensé par un impact net favorable de +3,6 millions d'euros résultant d’une diminution des dépenses opérationnelles au cours du premier semestre 2025 par rapport à la même période en 2024, principalement liée au transfert à Janssen du sponsorship de l'étude 312 et à la suppression des obligations de financement des coûts de l'étude (voir la note 17.1 - Charges opérationnelles de R&D des états financiers consolidés intermédiaires résumés non audités inclus dans le présent rapport). Flux de trésorerie liés aux activités d'investissement Nos flux nets de trésorerie de la Société liés aux activités d'investissement se sont élevés à 0,2 million d'euros pour le semestre clos en juin 2025, principalement liés à l'acquisition d'immobilisations corporelles (voir Note 6 - Immobilisations corporelles des états financiers consolidés résumés intermédiaires non audités inclus dans le présent rapport). Pour le semestre clos au 30 juin 2024, les flux nets de trésorerie liés aux activités d'investissement s'élevaient à 0,5 million d’euros principalement liés à l'acquisition d'immobilisations corporelles. Page 8 Flux de trésorerie liés aux activités de financement Nos flux nets de trésorerie de la Société liés aux activités de financement se sont élevés à 2,8 millions d'euros pour le semestre clos le 30 juin 2025, contre 2,7 millions d'euros pour le semestre clos le 30 juin 2024. Les flux nets de trésorerie liés aux activités de financement pour le semestre clos le 30 juin 2025 sont principalement attribuables au remboursement des prêts, y compris les intérêts, pour respectivement 1,3 million d'euros de PGE, 0,2 million d'euros à la BEI et 0,7 million d'euros à BPI et aux paiements de dettes de locations pour 0,6 million d'euros. Les flux nets de trésorerie liés aux activités de financement pour le semestre clos le 30 juin 2024 étaient principalement attribuables au remboursement de prêts, y compris les intérêts, pour respectivement 1,3 millions d'euros de PGE, 0,5 million d'euros à la BEI et 0,3 million d'euros à BPI et aux paiements de dettes de locations pour 0,5 million d'euros. 7.3 Avances remboursables, prêts et dettes de location Les avances remboursables, les prêts et les dettes de location de la Société sont présentés à la Section II, Note 13 - Passifs financiers des états financiers intermédiaires résumés non audités inclus dans le présent rapport. 7.4 Besoin de fonds propres opérationnels Depuis notre création, nous avons enregistré des pertes d'exploitation chaque année, principalement en raison des dépenses de recherche et développement engagées dans le cadre de nos efforts pour faire avancer le programme de développement pour JNJ-1900 (NBTXR3). Nos pertes nettes ont été de 5,4 millions d'euros et de 21,9 millions d'euros pour les semestres clos les 30 juin 2025 et 2024, respectivement. Au 30 juin 2025, la Société disposait de 28,8 millions d'euros de trésorerie et d'équivalents de trésorerie disponibles, composés de liquidités et de dépôts bancaires à court terme, liquides et facilement convertibles dans un délai de 3 mois sans pénalité ni risque de changement de valeur (voir Note 9. – Trésorerie et équivalents de trésorerie des états financiers consolidés intermédiaires résumés non audités inclus dans le présent rapport). À la date d'autorisation de publication des présents états financiers consolidés intermédiaires résumés non audités, la Société estime, compte tenu de sa structure de coûts actuelle et de ses engagements de dépenses prévisionnels, disposer de fonds suffisants pour financer ses activités jusqu'au milieu de l’année 2026. Par conséquent, la trésorerie et les équivalents de trésorerie actuels de la Société ne seront pas suffisants pour couvrir ses besoins d'exploitation pendant les 12 prochains mois suivant la date de publication des présents états financiers. Sur la base de son plan d'affaires actuel, la Société estime que pour honorer ses obligations au cours des 12 prochains mois, elle aura besoin de liquidités supplémentaires de l'ordre de 8 à 10 millions d'euros. Ces événements et conditions indiquent qu’il existe une incertitude significative susceptible de remettre en cause la capacité de la Société à poursuivre ses activités et, par conséquent, Nanobiotix pourrait ne pas être en mesure de réaliser ses actifs et de s'acquitter de ses passifs dans le cadre normal de ses activités. Cette estimation est basée sur le plan d'affaires actuel de la Société et exclut (i) les autres dépenses résultant d'éventuelles acquisitions de licences ou de produits candidats ou de technologies complémentaires, ou de tout développement associé que la Société pourrait entreprendre; (ii) les éventuels paiements d'étape que la Société pourrait recevoir ou verser, ou tout potentiel financement supplémentaire. De plus, la Société pourrait avoir fondé cette estimation sur des hypothèses erronées et pourrait être amenée à utiliser ses ressources plus tôt que prévu. Pour financer son activité, la Société a besoin de lever des fonds supplémentaires et est actuellement en discussion pour l’obtention d’un financement non dilutif destiné à étendre de manière significative son horizon de trésorerie au delà de la période de 12 mois. Par ailleurs, indépendamment de ces discussions, la Société pourrait chercher à lever des fonds supplémentaires pour atteindre ses objectifs de développement pour ses programmes de recherche et développement par le biais : • de potentielles levées de fonds par émission de titres financiers, que ce soit par offre publique ou privée à des investisseurs qualifiés ; • d'éventuelles transactions stratégiques telles que des partenariats de développement commercial; et • subventions pour projets de R&D. La Société ne peut garantir qu'elle sera en mesure d'obtenir le financement nécessaire, par l'une des mesures susmentionnées ou autrement, pour répondre à ses besoins ou pour obtenir des fonds avec des termes et conditions acceptables, dans les délais impartis, voire pas du tout, compte tenu notamment du contexte généralement difficile du financement des entreprises de biotechnologie. Si la Société n’est pas en mesure d’obtenir Page 9 un financement en temps opportun, elle pourrait être obligée de réduire, de retarder ou d’interrompre de manière significative un ou plusieurs de ses programmes de recherche ou de développement ou la commercialisation de tout produit approuvé, ou de ne pas être en mesure d’étendre ses opérations ou de capitaliser sur ses opportunités commerciales, comme elle le souhaite, ce qui pourrait nuire aux perspectives et aux opérations commerciales de la Société. Nos besoins de financement actuels et futurs dépendront de nombreux facteurs, notamment : • le nombre, la taille, l’avancement, le calendrier et l’achèvement de nos essais cliniques ; • le suivi de l’allocation des capitaux et des coûts engagés, y compris les charges liées au personnel ; • le nombre de nouveaux produits candidats potentiels que nous identifions et décidons de développer, notamment grâce au développement de nos plateformes Curadigm et OOcuity ; • les coûts liés au dépôt de demandes de brevet, à leur maintien et à leur application, ou à la défense contre les réclamations ou contrefaçons formulées par des tiers ; • le temps et les coûts liés à l’obtention de l’approbation réglementaire pour nos produits candidats et les retards que nous pourrions rencontrer en raison de l’évolution des exigences réglementaires ou de résultats défavorables concernant l’un de ces produits candidats ; • les activités de vente et de marketing entreprises dans le cadre de la commercialisation potentielle de futurs produits candidats et les coûts liés à la création d’une organisation commerciale et marketing efficace ; et • le montant des revenus, le cas échéant, que nous pourrions tirer, directement ou sous forme de paiements d’étape ou de redevances, de nos accords de partenariat ou de collaboration existants ou futurs. Page 10 II. Comptes consolidés résumés Page 11 COMPTES SEMESTRIELS CONSOLIDES RÉSUMÉS PÉRIODE DU 1er JANVIER AU 30 JUIN 2025 Page 12 ÉTAT INTERMÉDIAIRE RÉSUMÉ DE LA SITUATION FINANCIÈRE CONSOLIDÉ (Montants en milliers d’euros) 31 décembre ACTIF Notes 30 juin 2025 2024 Actifs non courants Immobilisations incorporelles 5 13 7 Immobilisations corporelles 6 4 863 5 538 Immobilisations financières 7 409 406 Total des actifs non courants 5 284 5 951 Actifs courants Clients et comptes rattachés 8.1 1 837 2 977 Autres actifs courants 8.2 9 234 8 753 Trésorerie et équivalents de trésorerie 9 28 818 49 737 Total des actifs courants 39 889 61 466 TOTAL DE L'ACTIF 45 174 67 418 31 décembre PASSIF ET CAPITAUX PROPRES Notes 30 juin 2025 2024 Capitaux propres Capital 10.1 1 447 1 423 Primes liées au capital 10.1 312 743 312 743 Autres éléments du résultat global cumulés 686 712 Actions propres (228) (228) Réserves (378 217) (312 221) Résultat net (5 383) (68 132) Total des capitaux propres (68 952) (65 704) Passifs non courants Provisions - part non courante 11 479 432 Dettes financières - part non courante 13 46 505 45 978 Passif de remboursement - part non courante 14.4 4 105 27 778 Total des passifs non courants 51 089 74 187 Passifs courants Provisions - part courante 12 167 438 Dettes financières - part courante 13 4 735 4 924 Fournisseurs et comptes rattachés 14.1 11 639 20 036 Autres passifs courants 14.2 7 000 7 543 Produits constatés d’avance 50 61 Passifs de contrats - part courante 14.3 36 172 18 100 Passif de remboursement - part courante 14.4 3 273 7 835 Total des passifs courants 63 037 58 935 Total du passif 114 126 133 122 TOTAL DU PASSIF ET DES CAPITAUX PROPRES 45 174 67 418 Les notes annexées font partie intégrante de ces comptes consolidés semestriels résumés. Page 13 COMPTE DE RÉSULTAT CONSOLIDÉ INTERMÉDIAIRE RÉSUMÉ (Montants en milliers d’euros sauf résultat par action) 30 juin 2025 30 juin 2024 Notes Chiffre d'affaires et autres produits Chiffre d'affaires 16 24 928 6 163 Autres produits d’exploitation 16 1 710 3 126 Total du Chiffre d’affaire et Autres produits 26 638 9 289 d’exploitation Frais de recherche et de développement 17.1 (14 529) (21 987) Frais commerciaux, généraux et administratifs 17.2 (11 294) (10 819) Autres produits et charges opérationnels 17.5 (7) (134) Total des charges opérationnelles (25 829) (32 941) Résultat opérationnel 808 (23 652) Produits financiers 19 645 3 386 Charges financières 19 (6 831) (1 463) Résultat financier (6 186) 1 924 Impôts sur les sociétés (6) (144) Résultat net (5 383) (21 872) Résultat de base par action (en euros) 21 (0,11) (0,46) Résultat dilué par action (en euros) 21 (0,11) (0,46) Les notes annexées font partie intégrante de ces comptes consolidés semestriels résumés. Page 14 ÉTAT INTERMÉDIAIRE RÉSUMÉ DU RÉSULTAT GLOBAL CONSOLIDÉ (Montants en milliers d’euros) 30 juin 2025 30 juin 2024 Notes Résultat net (5 383) (21 872) Ecarts actuariels sur engagements de retraite — — (IAS 19) Impact fiscal — — Autres éléments du résultat global qui ne seront pas reclassés ultérieurement en résultat net — — Ecarts de conversion (26) (2) Impact fiscal — — Autres éléments du résultat global qui seront (26) (2) reclassés ultérieurement en résultat net Résultat global (5 409) (21 874) Les notes annexées font partie intégrante de ces comptes consolidés semestriels résumés. Page 15 ÉTAT INTERMÉDIAIRE RÉSUMÉ DE VARIATION DES CAPITAUX PROPRES CONSOLIDÉS (Montants en milliers d’euros, à l’exception du nombre d’actions) Capital social Autres éléments Total Primes Nombre du Actions des Notes Montant liées au Réserves Résultat d'actions résultat propres capitaux capital global propres cumulés 31 décembre 2024 47 426 851 1 423 312 743 712 (228) (312 221) (68 132) (65 704) Résultat net — — — — — — (5 383) (5 383) Ecarts de conversion — — — (26) — — — (26) Ecarts actuariels (IAS 11 — — — — — — — — 19) Résultat global — — — (26) — — (5 383) (5 409) Affectation du résultat 10.1 — — — — — (68 132) 68 132 — d’exercices antérieurs Augmentation de 10.1 809 820 24 — — — (24) — — capital Souscription BSA/ 10.2 — — — — — — — — Attribution AGA Paiement fondé sur des — — — — — 2 161 — 2 161 actions 30 juin 2025 48 236 671 1 447 312 743 686 (228) (378 217) (5 383) (68 952) Capital social Autres éléments Total Primes Nombre du Actions des Notes Montant liées au Réserves Résultat d'actions résultat propres capitaux capital global propres cumulés 31 décembre 2023 47 133 328 1 414 312 742 738 (228) (276 810) (39 700) (1 843) Résultat net — — — — — — (21 872) (21 872) Ecarts de conversion — — — (2) — — — (2) Ecarts actuariels (IAS 11 — — — — — — — — 19) Résultat global — — — (2) — — (21 872) (21 874) Affectation du résultat — — — — — (39 700) 39 700 — d’exercices antérieurs Augmentation de 293 523 9 — — — (9) — — capital Souscription BSA / 10.2 — — — — — — — — Attribution AGA Paiements fondés sur 18 — — — — — — — — les actions 30 juin 2024 47 426 851 1 423 312 743 736 (228) (314 578) (21 872) (21 777) Les notes annexées font partie intégrante de ces comptes consolidés semestriels résumés. Page 16 ÉTAT INTERMÉDIAIRE RÉSUMÉ DE FLUX DE TRÉSORERIE CONSOLIDÉS (Montants en milliers d’euros) 30 juin 2025 30 juin 2024 Notes Flux de trésorerie liés aux activités opérationnelles Résultat net (5 383) (21 872) Élimination des éléments sans incidence sur la trésorerie Dotation aux amortissements 17.4 800 786 Provisions 12 (231) (115) Charges liées aux paiements fondés sur des actions 18 2 161 1 940 Coût de l'endettement financier net 19 842 1 101 Perte sur cession — 8 Effet de l'actualisation des passifs financiers et coût amorti 19 2 365 37 Charge d’impôt 6 144 Autres produits et charges sans impact sur la trésorerie 392 — Impact de l’amendement Janssen sur le résultat 16 (19 823) — Flux de trésorerie liés aux activités opérationnelles avant (18 873) (17 970) impôt et variation du besoin en fonds de roulement Impôt versé (205) (114) Flux de trésorerie liés aux activités opérationnelles après (19 077) (18 084) impôt et avant variation du besoin en fonds de roulement (Augmentation)/Diminution des clients et comptes rattachés 8.1 1 139 (2 214) Remboursement du crédit d'impôt recherche 8.2 124 — (Augmentation) des autres créances 8.2 (620) 157 (Augmentation)/Diminution des fournisseurs et comptes rattachés 14.1 1 293 1 070 Augmentation/(Diminution) des autres passifs courants 14.2 (260) (436) Augmentation des revenus différés et passifs aux contrats 14.3 (11) 13 671 Variation du besoin en fonds de roulement 1 666 12 248 Flux nets de trésorerie liés aux activités opérationnelles (17 411) (5 836) Flux de trésorerie liés aux activités d'investissement Acquisitions d'immobilisations incorporelles 5 (8) (2) Acquisitions d'immobilisations corporelles 6 (150) (489) (Augmentation)/Diminution des immobilisations financières 7 (3) (9) Flux nets de trésorerie liés aux activités d'investissement (162) (500) Flux de trésorerie liés aux activités de financement Souscription d'emprunt et avance remboursable 13 — — Remboursement des emprunts 13.1 (1 926) (1 525) Remboursement dette locative 13.1 (568) (521) Intérêts financiers 13.1 (336) (609) Flux net de trésorerie liés aux activités de financement (2 830) (2 655) Incidence de la variation des taux de change (515) 43 Variation de trésorerie (20 919) (8 948) Trésorerie à l'ouverture 49 737 75 283 Trésorerie à la clôture 9 28 818 66 335 Les notes annexées font partie intégrante de ces comptes consolidés semestriels résumés. Page 17 ANNEXES AUX ÉTATS FINANCIERS CONSOLIDÉS AU 30 JUIN 2025 1. Informations relatives à l’entreprise Nanobiotix, Société Anonyme immatriculée au registre du commerce et des sociétés de Paris sous le numéro 447 521 600 et ayant son siège social au 60 rue de Wattignies, 75012, Paris (« Nanobiotix » ou la « Société » et, avec ses filiales, le « Groupe »), est une société de biotechnologie au stade clinique et en phase avancée, pionnière dans les approches thérapeutiques novatrices fondées sur les nanoparticules pour le traitement du cancer et d’autres besoins médicaux importants avec l’intention expresse d’avoir un impact favorable sur la vie de millions de patients. Créée en 2003, Nanobiotix a son siège social à Paris, France. La Société possède également des filiales à Cambridge, Massachusetts (États-Unis), en Espagne et en Allemagne. Le Groupe est coté sur Euronext : Paris sous le symbole « NANO » depuis 2012 (ISIN : FR0011341205, Code Bloomberg : NANO:FP) et sur le Nasdaq Global Select Market sous le symbole « NBTX » aux États-Unis depuis décembre 2020. Le Groupe est propriétaire de plus de 25 familles de brevets associés à trois plateformes nanotechnologiques : 1) la plateforme de radioenhancers dont JNJ-1900 (NBTXR3) est le premier produit candidat conçu pour détruire localement les cellules tumorales et activer une réponse immunitaire de manière systémique ; (2) la plateforme de nanoprimers Curadigm conçue pour redéfinir la conception et l’application de classes thérapeutiques confrontées à l’élimination hépatique ; et (3) OOcuity pour les maladies neurologiques. La Société concentre ses efforts sur le développement de JNJ-1900 (NBTXR3). Événements importants de la période Amendement de la Licence Janssen Un amendement à l'accord de licence global a été signé le 17 mars 2025 avec Janssen Pharmaceutica NV ; cet amendement à l'accord de licence global supprime l'obligation de financement de la société pour le NANORAY-312 et libère Janssen de certains paiements d'étape futurs, tout en préservant la voie de la société vers un flux de trésorerie durable grâce à d'importants paiements d'étape potentiels au cours des prochaines années. Le total des paiements attendus lié à l'Accord Janssen est ramenée d'environ 2,7 milliards de dollars à environ 2,6 milliards de dollars : • Les révisions des paiements d'étape potentiels dans l'amendement s'élèvent à 105 millions de dollars, tout en maintenant les premiers paiements d’étapes significatifs potentiels et des centaines de millions de paiements d'étape potentiels dans les 2 - 3 prochaines années liés aux deux premiers programmes (cancer de la tête et du cou non éligible au cisplatine et cancer du poumon non résécable de stade 3), • Au-delà des centaines de millions de paiements d'étape potentiels dans les 2 - 3 prochaines années pour les deux premiers programmes, le reste des 2,6 milliards de dollars est lié à des paiements d'étape potentiels à moyen et long terme pour le développement, la réglementation et les ventes des deux premiers programmes, ainsi qu'à des paiements potentiels pour de nouvelles indications susceptibles d'être développées par Janssen, et à des paiements d'étape potentiels à moyen et long terme pour de nouvelles indications susceptibles d'être développées par Janssen. • Aucun changement n'a été apporté au montant potentiel de 220 millions de dollars par nouvelle indication susceptible d'être développée par Nanobiotix, et les redevances potentielles attendues des ventes commerciales de JNJ-1900 (NBTXR3) restent comprises entre 10 et 20 %. Les paiements potentiels pour les nouvelles indications susceptibles d'être développées par la société s'ajoutent à la valeur de l'accord de 2,6 milliards de dollars, ainsi qu'aux redevances potentielles correspondantes. L'amendement prévoit que Janssen assumera la quasi-totalité de la responsabilité financière de NANORAY-312, l'essai pivot de phase 3 en cours jusqu'à son achèvement, moins une petite partie des coûts qui resteront couverts par la Société, permettant à la Société de renforcer sa position financière. Pour plus de détails, voir la Note 16 - Produits des activités ordinaires. Page 18 2. Principes généraux et base de présentation des états financiers Les états financiers consolidés intermédiaires résumés non audités pour le semestre clos le 30 juin 2025 ont été préparés sous la supervision de la direction de la Société et soumis par le Directoire à la revue par le Conseil de Surveillance de la Société. Sauf indication contraire, tous les montants figurant dans les états financiers consolidés intermédiaires résumés non audités sont présentés en milliers d’euros. Des données chiffrées ayant été arrondies, les totaux dans certains tableaux peuvent ne pas être la somme exacte des chiffres qui les précèdent. Les états financiers consolidés résumés non audités de la Société ont été préparés conformément à la norme IAS 34 - " Information financière intermédiaire " qui prévoit la présentation d'une sélection de notes explicatives. S'agissant d'états financiers consolidés intermédiaires résumés non audités, les notes annexes ne contiennent pas toutes les informations requises pour les états financiers consolidés annuels et doivent donc être lues conjointement avec les états financiers consolidés de la Société préparés conformément aux normes comptables IFRS®, pour l'exercice clos le 31 décembre 2024. L'établissement des états financiers consolidés intermédiaires résumés non audités conformément à la norme IAS 34 – « Information financière intermédiaire » nécessite le recours à des estimations et à des hypothèses qui influent sur les montants et les informations présentés dans les états financiers consolidés résumés. Voir la note 3.2 - Recours au jugement, aux estimations et aux hypothèses. Les principes comptables suivis pour l’établissement des états financiers consolidés intermédiaires non audités pour le semestre clos le 30 juin 2025 sont identiques à ceux utilisés pour l’exercice clos le 31 décembre 2024, à l’exception des normes énumérées ci-dessous dont l’adoption était obligatoire en 2025. Caractère saisonnier des activités de la Société Selon IAS 34 - « Information financière intermédiaire », une entité dont les activités sont extrêmement saisonnières devrait présenter les informations financières pour les douze mois précédant la fin de la période intermédiaire ainsi que des informations comparatives supplémentaires pour les douze mois précédents dans les états financiers résumés intermédiaires afin de permettre une meilleure compréhension et une meilleure comparaison de ses états financiers consolidés intermédiaires. Comme indiqué dans la Note 16 - Produits des activités ordinaires, la majeure partie des produits de la Société étant générée par des contrats en cours reposant principalement sur des obligations de performance non corrélées à des tendances saisonnières, il est considéré que les activités de la Société ne sont pas saisonnières. Par conséquent, les états financiers consolidés résumés intermédiaires non audités suivants et les notes correspondantes n'incluent pas d'autres informations comparatives que celles mentionnées par IAS 34.20. Normes, amendements aux normes existantes et interprétations publiés par l'IASB et d'application obligatoire depuis le 1er janvier 2025 L'application des normes, amendements aux normes existantes et interprétations d'application obligatoire depuis le 1er janvier 2025 dans l'Union européenne concerne principalement : ■ Modification de l'IAS 21 « Absence de convertibilité ; effets des variations des cours des monnaies étrangères ». Cet amendement n'a eu aucune incidence significative sur les états financiers consolidés intermédiaires résumés non audités de la Société pour le semestre clos le 30 juin 2025. Normes, amendements de normes existantes et interprétations publiés par l'IASB dont l'application n'est pas encore obligatoire Les nouvelles normes, interprétations et amendements de normes existantes publiés mais non encore applicables sont : ■ Amendements aux normes IFRS 9 et IFRS 7 – Classification et évaluation des instruments financiers – à compter du 1er janvier 2026 ■ Amendements aux normes IFRS 9 et IFRS 7 – Contrats faisant référence à de l'électricité dépendante de la nature – à compter du 1er janvier 2026 ■ Améliorations annuelles des normes comptables IFRS, à compter du 1er janvier 2026 – Amendements à : • IFRS 1 Première application des Normes internationales d'information financière ; Page 19 • IFRS 7 Instruments financiers : Informations à fournir et ses indications sur la mise en œuvre d'IFRS 7 ; • IFRS 9 Instruments financiers ; • IFRS 10 États financiers consolidés ; et • IAS 7 Tableau des flux de trésorerie ■ Nouvelle norme – IFRS 18 – Présentation et informations à fournir dans les états financiers – à compter du 1er janvier 2027 ■ Nouvelle norme – IFRS 19 – Filiales sans responsabilité publique : Informations à fournir – à compter du 1er janvier 2027 La Société évalue actuellement l'applicabilité et l'impact de ces nouvelles normes, interprétations et modifications. Continuité d'exploitation Depuis sa création, la Société a financé sa croissance par des augmentations de capital successives, des emprunts, des accords de collaboration et de licence, ainsi que le paiement de créances de crédit d'impôt recherche (CIR). La Société poursuit ses activités de recherche et développement pour ses produits candidats. La Société a enregistré des pertes d'exploitation et des flux de trésorerie négatifs en raison du caractère innovant des produits candidats qu'elle développe, nécessitant une phase de recherche et développement s'étalant sur plusieurs années. La Société ne prévoit pas de générer de revenus provenant de la vente de ses produits dans un avenir proche. En mars 2025, la Société et Janssen BV ont signé un avenant au contrat de licence. Cet avenant prévoit que Janssen assumera la quasi-totalité de la responsabilité financière de NANORAY-312, l'essai pivot de phase 3 en cours jusqu'à son achèvement, à l’exception d’une petite partie des coûts restant à la charge de la Société, lui permettant d'étendre son horizon de trésorerie et de réduire ses coûts d'exploitation après cet amendement, y compris sur la période au-delà de mi-2026. Au 30 juin 2025, la Société disposait de 28,8 millions d'euros de trésorerie et d'équivalents de trésorerie disponibles, composés de liquidités et de dépôts bancaires à court terme, liquides et facilement convertibles dans un délai de 3 mois sans pénalité ni risque de variation de valeur (voir Note 9. – Trésorerie et équivalents de trésorerie). À la date d'autorisation de publication des présents états financiers consolidés intermédiaires résumés, la Société estime, compte tenu de sa structure de coûts actuelle et de ses engagements de dépenses prévisionnels, être en mesure de financer ses activités jusqu'au milieu de l’année 2026. En conséquence, la Société ne dispose pas d'un niveau de liquidités suffisant pour couvrir ses besoins d’exploitation pendant les 12 prochains mois suivant la date de publication des présents états financiers. Sur la base de son plan d'affaires actuel, la Société estime que pour honorer ses obligations au cours des 12 prochains mois, elle aura besoin de liquidités supplémentaires de l'ordre de 8 à 10 millions d'euros. Ces événements et conditions indiquent qu’il existe une incertitude significative susceptible de remettre en cause la capacité de la Société à poursuivre ses activités et, par conséquent, Nanobiotix pourrait ne pas être en mesure de réaliser ses actifs et de s'acquitter de ses passifs dans le cadre normal de ses activités. Cette estimation est basée sur le plan d'affaires actuel de la Société et exclut (i) les autres dépenses résultant d'éventuelles acquisitions de licences ou de technologies supplémentaires, ou de tout développement connexe que la Société pourrait entreprendre ; (ii) les éventuels paiements d'étape que la Société pourrait recevoir ou verser, ou tout financement supplémentaire potentiel. La Société pourrait avoir fondé cette estimation sur des hypothèses erronées et être amenée à utiliser ses ressources plus tôt que prévu. Pour financer ses activités au-delà de mi-2026, la Société a besoin de lever des fonds supplémentaires et est actuellement en discussion pour l’obtention d’un financement non dilutif destiné à étendre de manière significative son horizon de trésorerie au-delà de la période des 12 mois. Par ailleurs, indépendamment de ces discussions, la Société pourrait chercher à lever des fonds supplémentaires pour atteindre ses objectifs de développement pour ses programmes de recherche et développement par le biais : • de potentielles levées de fonds par émission de titres financiers, que ce soit par offre publique ou privée à des investisseurs qualifiés ; • d’éventuelles transactions stratégiques telles que des partenariats de développement commerciaux; et • de subventions de projets de R&D. Sur cette base, les états financiers consolidés intermédiaires résumés au 30 juin 2025, pour la période de six mois close à cette date, ont été préparés sur la base du principe de continuité d'exploitation, en supposant que la Société sera capable de poursuivre ses activités dans un avenir prévisible et de faire face à ses besoins d’exploitation en Page 20 menant des actions visant à générer des revenus complémentaires et en pilotant étroitement ses dépenses opérationnelles. Par conséquent, ils n'incluent aucun ajustement relatif à la valeur ou à la classification des actifs et des passifs qui pourrait être requis si la Société n'était pas en mesure de poursuivre son exploitation. La Société ne peut garantir qu’elle sera en mesure d’obtenir le financement nécessaire, par l’une quelconque des mesures susmentionnées ou autrement, pour répondre à ses besoins ou d’obtenir des fonds à des conditions acceptables, dans les délais impartis, voire pas du tout, compte tenu notamment du contexte généralement difficile pour le financement des sociétés de biotechnologie. Si la Société ne parvient pas à obtenir un financement dans les délais impartis, elle pourrait être contrainte de réduire, de retarder ou d’interrompre considérablement un ou plusieurs de ses programmes de recherche ou développement ou la commercialisation de tout produit approuvé, ou de se trouver dans l’impossibilité d’étendre ses activités ou de tirer parti de ses opportunités commerciales comme elle le souhaite, ce qui compromettrait ses perspectives et ses activités. 3. Principes et méthodes de consolidation 3.1 PRINCIPES DE CONSOLIDATION Entités consolidées Au 30 juin 2025, le périmètre de consolidation est composé d'une seule entité mère et est similaire à celui du 31 décembre 2024 avec une entité mère Nanobiotix S.A. et trois filiales détenues à 100% : • Nanobiotix Corp., créée dans l'État du Delaware en septembre 2014 et située aux États-Unis, • Nanobiotix Germany GmbH, créée en octobre 2017 et située en Allemagne, • Nanobiotix Spain S.L.U., créée en décembre 2017 et située en Espagne, En conséquence, les états financiers intermédiaires consolidés non audités au 30 juin 2025 et pour l’exercice clos à cette date comprennent les activités de chacune de ces filiales à partir de la date de leur constitution. Transaction en monnaie étrangère Les états financiers consolidés résumés intermédiaires non audités sont présentés en milliers d’euros, qui est la monnaie de présentation du Groupe et la monnaie fonctionnelle de la société mère, Nanobiotix S.A. Les états financiers des sociétés étrangères dont la monnaie fonctionnelle est différente de l’euro sont convertis au cours de clôture pour les éléments de bilan ; les éléments du compte de résultat, de l’état du résultat global et du tableau des flux de trésorerie sont convertis au cours moyen de la période présentée, sauf lorsque cette méthode ne peut être appliquée du fait d’importantes fluctuations des taux de change au cours de la période concernée. Le cours de clôture et le cours moyen euro-dollar utilisés dans les états financiers consolidés résumés intermédiaires non audités pour convertir les opérations du Groupe libellées en dollars américains sont respectivement au 30 juin 2025 1,1720 $ et 1,0930 $ contre 1,0705 $ et 1,0812 $ au 30 juin 2024 (source : Banque de France). Les écarts de conversion en résultant sont comptabilisés dans les autres éléments du résultat global en tant qu’écart de conversion cumulé. 3.2 RECOURS AU JUGEMENT, AUX ESTIMATIONS ET AUX HYPOTHESES La préparation des états financiers consolidés résumés intermédiaires non audités conformément aux normes IAS 34 nécessite l’utilisation d’estimations et d’hypothèses qui affectent les montants et les informations figurant dans les états financiers. Les estimations et les jugements utilisés par la direction sont basés sur des informations historiques et sur d’autres facteurs, y compris des attentes concernant des événements futurs considérés comme raisonnables compte tenu des circonstances. Ces estimations peuvent être révisées lorsque les circonstances sur lesquelles elles sont fondées changent. Par conséquent, les résultats réels peuvent varier de manière significative par rapport à ces estimations en fonction des différentes hypothèses ou conditions. Un test de sensibilité pourrait être présenté dans le cas où les résultats pourraient différer de façon importante en fonction de l’application de différents hypothèses ou conditions. Les principaux éléments concernés par l’utilisation d’estimations sont la continuité d’exploitation, les paiements fondés sur des actions, les actifs d'impôts différés, les charges à payer dans le cadre des essais cliniques, la reconnaissance du revenu et l’évaluation de la juste valeur des instruments financiers (juste valeur et coûts amortis). Évaluation des paiements fondés sur des actions Page 21 La Société évalue la juste valeur des options de souscription d’actions (OSA), des bons de souscription de parts de créateur d’entreprise (BSPCE), des bons de souscription d’actions (BSA) et des attributions gratuites d’actions (AGA) accordés aux salariés, aux membres du Directoire et du Conseil de surveillance et aux consultants sur la base de modèles actuariels. Ces modèles actuariels exigent que la Société utilise certaines hypothèses de calcul concernant les caractéristiques des attributions (par exemple, les conditions d’acquisition des droits) et les données de marché (par exemple, pour déterminer la volatilité attendue du prix des actions) (voir Note 18 - Paiements fondés sur des actions). Impôts différés actifs Des impôts différés sont comptabilisés pour les différences temporaires résultant de la différence entre la base fiscale et la base comptable des actifs et des passifs de la Société qui apparaissent dans ses états financiers. La principale source d'actifs d'impôts différés est liée aux pertes fiscales non utilisées qui peuvent être reportées en avant ou en arrière, selon la juridiction. Les taux d’imposition en vigueur sont utilisés pour évaluer les impôts différés. Les actifs d’impôts différés ne sont enregistrés dans les comptes que dans la mesure où il est probable que les bénéfices futurs seront suffisants pour absorber les pertes reportables en avant ou en arrière. Compte tenu de son stade de développement, ne permettant pas d’établir des projections de résultat suffisamment fiables, la Société n’a pas comptabilisé d’actifs d’impôts différés relatifs aux pertes fiscales reportables dans les états de la situation financière consolidée. Provisions au titre des essais cliniques Les dépenses relatives aux essais cliniques encourues sur l’exercice mais qui n’ont pas encore été entièrement facturées à la date de la clôture sont estimées trimestriellement pour chaque étude et une provision est enregistrée en conséquence (voir Note 14.1 - Fournisseurs et comptes rattachés pour des informations sur les provisions au titre des essais cliniques au 30 juin 2025 et au 31 décembre 2024). Reconnaissance du revenu Afin de déterminer le montant et le calendrier des revenus en vertu du contrat avec les clients, la Société fait appel à des jugements importants, principalement en ce qui concerne l'identification des obligations de performance de la Société et la détermination du calendrier de réalisation des services fournis aux clients, la répartition et l’estimation du prix de transaction et la détermination du calendrier de réalisation des services fournis aux clients. Détermination du caractère distinctif des obligations de prestation — Un bien ou un service promis devra être comptabilisé séparément dans les produits s'il est distinct au sens de la norme IFRS 15. Pour déterminer si l'obligation de prestation est distincte, la Société analyse si (i) le bien ou le service est distincte dans l'absolu, c'est- à-dire qu'elle peut être utile au client, soit seule, soit en combinaison avec des ressources que le client peut obtenir séparément ; et si (ii) le bien ou le service est distinct dans le contexte du contrat, c'est-à-dire qu'il peut être identifié séparément des autres biens et services du contrat parce qu'il n'y a pas un degré élevé d'interdépendance ou d'intégration entre cet élément et l'autre bien ou service promis dans le contrat. Si l'une de ces deux conditions n'est pas remplie, le bien ou le service n'est pas distinct et la Société doit le regrouper avec d'autres biens ou services promis jusqu'à ce qu'il devienne un groupe distinct de biens ou de services. Affectation du prix de transaction aux obligations de prestation — Le prix de transaction d'un contrat est affecté à chaque obligation de prestation distincte et comptabilisé en tant que produit lorsque, ou au fur et à mesure que, l'obligation de prestation est satisfaite.. Pour les contrats comportant plusieurs obligations de performance, la Société alloue le prix de transaction du contrat à chaque obligation de performance en utilisant notre meilleure estimation du prix de vente autonome de chaque bien ou service distinct dans le contrat. Contrepartie variable — En raison de la nature du travail à effectuer sur de nombreuses obligations de prestation de la Société, l'estimation du total des revenus et des coûts à l'achèvement est complexe, sujette à de nombreuses variables et nécessite un jugement important. Il est courant que les accords de collaboration et de licence contiennent une contrepartie variable qui peut augmenter le prix de la transaction. La variabilité du prix de transaction découle principalement des paiements d'étape obtenus à la suite de la réalisation d'étapes spécifiques (par exemple, des résultats scientifiques ou des approbations réglementaires ou commerciales). La Société inclut les montants correspondants dans le prix de transaction uniquement dans la mesure où il est hautement probable qu’une inversion significative du montant des revenus cumulés reconnus ne se produira pas lorsque l’incertitude associée à la contrepartie variable sera ultérieurement résolue. L'effet de l'augmentation du prix de la transaction due aux paiements d'étape est comptabilisé comme un ajustement du chiffre d'affaires sur une base de rattrapage cumulé. Page 22 Reconnaissance des produits des activités ordinaires et méthode d’avancement par les coûts — Certaines obligations de performance de la Société sont satisfaites progressivement, à mesure de l'avancement des travaux. Les produits des activités ordinaires sont donc comptabilisés progressivement, selon une méthode d'avancement par les coûts, car elle reflète au mieux le transfert de contrôle aux clients. Modification de contrat — La Société comptabilise une modification de contrat comme si elle faisait partie intégrante du contrat existant si les biens ou services restants ne sont pas distincts et, par conséquent, font partie d'une obligation de performance unique partiellement satisfaite à la date de la modification. L'effet de la modification de contrat sur le prix de transaction et sur la mesure de l'avancement de l'obligation de performance par l'entité est comptabilisé comme un ajustement du produit des activités ordinaires à la date de la modification (c'est-à-dire selon une méthode de rattrapage cumulé). La Société est tenue d'exercer des jugements importants concernant l'identification et la détermination du prix de vente autonome modifié des obligations de performance, la répartition du prix de transaction et le calendrier ajusté de satisfaction des services restants fournis aux clients. Voir la Note 16 - Produits des activités ordinaires des états financiers consolidés au 31 décembre 2024 et pour l’exercice clos à cette date pour obtenir des détails supplémentaires sur les politiques comptables de la Société et les jugements spécifiques portés en matière de comptabilisation des revenus, ainsi que sur ses sources supplémentaires de revenus et autres revenus. Évaluation des actifs et passifs financiers A la date de renégociation en octobre 2022, la juste valeur du prêt accordé par la Banque Européenne d’Investissement (“BEI”) a nécessité à la Société de déterminer : – le taux d'actualisation du nouveau passif exécuté en octobre 2022. Le taux d'actualisation reflète le risque de crédit de la Société à la date de l'accord de modification ainsi qu'une prime pour refléter les incertitudes associées au calendrier et au montant du paiement des redevances. La Société a fait appel à des spécialistes externes de l'évaluation d’instruments financiers pour l'accompagner dans la détermination du taux d'actualisation moyen ; – le montant des intérêts supplémentaires ("redevances", telles que définies dans l'accord de redevances conclu avec la BEI) qui seront dus conformément à l'accord de prêt au cours d'une période de calcul des redevances commençant au moment de la commercialisation. Les redevances dues pendant cette période seront calculées en fonction du nombre de tranches perçues par la Société, et indexées sur le chiffre d'affaires annuel lié à JNJ-1900 (NBTXR3) par l'accord de licence spécifique de la Société. Afin d’évaluer la juste valeur du prêt BEI, la Société prévoit les ventes qu’elle s’attend à réaliser de JNJ-1900 (NBTXR3) pendant la période de redevance, en tenant compte des hypothèses opérationnelles telles que les dates de mise sur le marché des produits, le taux de croissance et de pénétration sur chaque marché. (Voir les notes 4.1.6.4.4 - Accord de financement avec la Banque européenne d'investissement (« BEI ») et 4.1.6.4.13 - Dettes financières des états financiers consolidés au 31 décembre 2024 pour plus de détails sur ce prêt et le traitement comptable appliqué). Suite à l'estimation de la juste valeur du prêt accordé par la BEI à la date de renégociation, la dette a été comptabilisée au coût amorti en fonction de la meilleure estimation révisée des flux de trésorerie futurs liés à la dette à chaque date de clôture. En conséquence, la Société détermine le montant des intérêts supplémentaires, tel que décrit ci-dessus. Tout ajustement ultérieur des flux indexés sur le chiffre d'affaires a été actualisé au taux d'intérêt effectif d'origine et l'ajustement est comptabilisé au compte de résultat selon la méthode du « rattrapage ». Au 30 juin 2025, la juste valeur du prêt BEI a été réévaluée par la Société à des fins de publication. 4. Contrats significatifs Les transactions significatives sont celles décrites dans les états financiers consolidés préparés conformément aux normes comptables IFRS ® pour l'exercice clos le 31 décembre 2024, à l'exception de l'Amendement de la Licence Janssen signé le 17 mars 2025 et décrit dans la Note 1 - Informations sur la Société et la Note 16 - Produits des activités ordinaires. Page 23 5. Immobilisations incorporelles L’évolution des immobilisations incorporelles s’analyse comme suit : 31 Autres Ecart de 30 juin (en milliers d'euros) décembre Augmentation Diminution mouvements & conversion 2025 2024 reclassement Brevets 65 7 — — — 72 Logiciels 669 1 — — — 669 Valeur brute des immobilisations 734 8 — — (448) 742 incorporelles Brevets (65) — — — — (65) Logiciels (662) (2) — — 448 (663) Amortissements cumulés des immobilisations (727) (2) — — — (729) incorporelles (1) Valeur nette comptable des immobilisations 7 6 — — — 13 incorporelles (1) Les charges de l’exercice sont détaillées dans la Note 17.4 Amortissements et provisions. Aucune dépréciation n’a été comptabilisée en application d’IAS 36 - « Dépréciation d’actifs » durant la période présentée. Page 24 6. Immobilisations corporelles L’évolution des immobilisations corporelles s’analyse comme suit : Autres 31 mouvements Ecart de 30 juin (en milliers d'euros) décembre Augmentation Diminution & conversion 2025 2024 reclassement Agencements et installations 3 390 65 — — — 3 455 Droit d'utilisation - immobilier 9 026 — — (92) — 8 934 Matériels techniques 2 492 61 — — — 2 553 Matériel de bureau et 1 258 25 (105) — (5) 1 173 informatique Immobilisations en cours 141 — (3) — — 138 Avances et acomptes sur 250 — — — — 250 immobilisations Valeur brute des immobilisations 16 559 150 (108) (92) (5) 16 504 corporelles Agencements et installations (2 582) (134) — — — (2 716) Droit d'utilisation - immobilier (5 473) (522) — 65 — (5 929) Matériels techniques (1 945) (90) — — — (2 035) Matériel de bureau et (1 021) (52) 108 — 4 (961) informatique Amortissements cumulés des immobilisations (11 021) (798) 108 65 4 (11 641) corporelles (1) Valeur nette comptable des immobilisations 5 538 (647) — (27) (1) 4 863 corporelles (1) Les charges de l’exercice sont détaillées dans la Note 17.4 Amortissements et provisions. Aucune dépréciation n’a été comptabilisée en application d’IAS 36 - « Dépréciation d’actifs » durant la période présentée. Page 25 7. Immobilisations financières L’évolution des immobilisations financières s’analyse comme suit : (en milliers d'euros) Dépôts et cautionnement versés Valeur nette au 31 décembre 2024 406 Augmentations 3 Diminutions — Reclassements — Ecarts de conversion (1) Valeur nette au 30 juin 2025 409 8. Créances clients et autres actifs courants 8.1 CRÉANCES CLIENTS 31 décembre (en milliers d'euros) 30 juin 2025 2024 Clients et comptes rattachés 1 837 2 977 Créances clients 1 837 2 977 Au 30 juin 2025, le solde des créances clients concerne principalement les créances non encaissées de Janssen, qui se composent de fournitures de produits déjà livrés pour 1,7 million d'euros. 8.2 AUTRES ACTIFS COURANTS Les autres actifs courants s’analysent comme suit : 31 décembre (en milliers d'euros) 30 juin 2025 2024 Crédit d'impôt recherche à recevoir 4 792 3 369 Créances fiscales hors IS 1 185 1 104 Charges constatées d'avance 1 925 3 195 Autres créances 1 332 1 085 Autres actifs courants 9 234 8 753 Au 30 juin 2025, les 1,9 million d’euros de charges constatées d’avance concernent principalement des accords de recherche avec MD Anderson pour 1,1 millions d’euros, contre 1,2 million d’euros au 31 décembre 2024, de factures reçues pour des prestations de tiers au-delà de la période de clôture actuelle pour 0,8 million d’euros, principalement de prestations informatiques, d’assurance et autres contrats administratifs annuels contre 1,1 million d’euros au 31 décembre 2024 et 46 milliers d’euros liés aux achats de produits cliniques non encore consommés à la date de clôture contre 0,6 millions d’euros au 31 décembre 2024, cette baisse significative s'explique par la dynamique des produits cliniques vendus. Les autres créances ont augmenté de 0,2 millions d’euros et sont principalement composées d'avances aux fournisseurs pour un montant de 1,3 million d'euros au 30 juin 2025 contre 1,1 millions d'euros au 31 décembre 2024. La plupart de ces avances de paiement ont été versés à une organisation de recherche sous contrat (CRO) et à un prestataire de services cliniques dans le cadre de la réalisation de l'étude NANORAY-312. Crédit d’impôt recherche La Société est éligible au CIR (Crédit d’Impôt Recherche) délivré par les administrations fiscales françaises et américaines. L’évolution de la créance du CIR se présente comme suit : Page 26 (en milliers d'euros) Créance au 31 décembre 2024 3 369 Produit CIR 2025 - Nanobiotix SA (1) 1 616 Produit CIR 2025 - Nanobiotix Corp (1) (69) Remboursement CIR 2024 - Nanobiotix Corp (124) Créance au 30 juin 2025 4 792 (1) Voir Note 16 - Produits des activités ordinaires. 9. Trésorerie et équivalents de trésorerie La trésorerie et les équivalents de trésorerie se répartissent comme suit : 31 décembre (en milliers d'euros) 30 juin 2025 2024 Trésorerie et équivalents de trésorerie 4 693 5 309 Dépôts à terme 24 125 44 427 Trésorerie et équivalents de trésorerie 28 818 49 737 Au 30 juin 2025, la trésorerie et équivalents de trésorerie est en diminution de 20,9 millions d'euros par rapport au 31 décembre 2024. Les dépôts bancaires à court terme correspondent exclusivement aux opérations de dépôts à terme qui ont été réglées en juillet 2025. Page 27 10. Capital 10.1 CAPITAL ÉMIS Analyse des opérations sur le capital (en milliers d’euros sauf nombre d’actions) Nature des opérations Primes liées Nombre Capital au capital d’actions Date 31 décembre 2024 1 423 312 743 47 426 851 27 juin 2025 Augmentation de capital AGA 2023-P1 et AGA 2023- 24 — 809 820 P2 30 juin 2025 1 447 312 743 48 236 671 Au 30 juin 2025, le capital social de la Société s’établit à 1 447 milliers d’euros, divisé en 48 236 671 actions ordinaires entièrement libérées d’un montant nominal de 0,03 €. Affectation du résultat (perte) Le résultat négatif de l'année 2023 de 68.1 millions d’euros a été intégralement affecté dans les réserves. 10.2 BONS DE SOUSCRIPTION DE PARTS DE CRÉATEUR D’ENTREPRISE (BSPCE), BONS DE SOUSCRIPTION D’ACTIONS (BSA), OPTIONS DE SOUSCRIPTION D’ACTIONS (OSA) ET ATTRIBUTIONS GRATUITES D’ACTIONS (AGA) Au 30 juin 2025, il existe trois types de valeurs mobilières et autres instruments valables donnant droit à une participation au capital de la Société : les bons de souscription d’actions (BSA), les bons de souscription de parts de créateur d’entreprise (BSPCE) et les options de souscription d’achat d’actions (OSA). Options de souscription d’actions (OSA) Le Directoire, lors de la réunion du 18 février 2025, agissant en vertu des délégations accordées par l’assemblée générale des actionnaires de la Société tenue le 28 mai 2024, a décidé d’émettre au profit de certains salariés du Groupe 8 000 OSA chacune donnant à son titulaire le droit de souscrire une action ordinaire, d'une valeur nominale de 0,03 € et au prix de 3,36 € (prime d’émission incluse). Ces OSA sont régies par le plan 2025, destiné à régir les options de souscription d’actions adopté par le Directoire le 18 février 2025 (le « 2025 Stock Option Plan »). Les OSA ordinaires pourront être exercées dans les conditions suivantes : • un premier tiers des OSA ordinaires sera exerçable à compter du 18 février 2026 ; • un second tiers des OSA ordinaires sera exerçable à compter du 18 février 2027 ; • le solde, soit un tiers des OSA ordinaires, sera exerçable à compter du 18 février 2028 ; sous réserve, pour chaque tranche, de la présence continue du bénéficiaire dans le Groupe au cours de la période de référence correspondante, et, dans tous les cas, au plus tard dans les dix ans suivant leur attribution, étant précisé que les OSA ordinaires qui n’auraient pas encore été exercées à l’expiration de cette période de dix années seraient caduques de plein droit. Le Directoire, lors de la réunion du 16 mai 2025, agissant en vertu des délégations accordées par l’assemblée générale des actionnaires de la Société tenue le 28 mai 2024, a décidé d’émettre au profit de certains salariés du Groupe ainsi que des membres du Directoire 1 241 005 OSA chacune donnant à son titulaire le droit de souscrire une action ordinaire, d'une valeur nominale de 0,03 € et au prix de 2,97 € (prime d’émission incluse). Ces OSA sont régies par le plan 2023, destiné à régir les options de souscription d’actions adopté par le Directoire le 20 juillet 2023, et approuvé par l’assemblée générale annuelle des actionnaires de la Société tenue le 27 juin 2023 (le « 2023 Stock Option Plan »). Les OSA ordinaires pourront être exercées dans les conditions suivantes : • un premier tiers des OSA ordinaires sera exerçable à compter du 16 mai 2026 ; • un second tiers des OSA ordinaires sera exerçable à compter du 16 mai 2027 ; • le solde, soit un tiers des OSA ordinaires, sera exerçable à compter du 16 mai 2028 ; sous réserve, pour chaque tranche, de la présence continue du bénéficiaire dans le Groupe au cours de la période de référence correspondante, et, dans tous les cas, au plus tard dans les dix ans suivant leur attribution, étant précisé que les OSA ordinaires qui n’auraient pas encore été exercées à l’expiration de cette période de dix années seraient caduques de plein droit. Attributions gratuites d’actions (AGA) Page 28 Aucun plan d’actions gratuites n'a été attribué au premier semestre 2025. Au 30 juin 2025, les hypothèses sur la probabilité de réalisation des conditions de performance des BSPCE, BSA et OSA performance ont été mises à jour (voir Note 18 - Paiements fondés sur des actions des états financiers consolidés intermédiaires résumés non audités inclus dans le présent rapport). 11. Engagements de retraite Analyse des provisions 31 décembre Ecart de (en milliers d’euros) Augmentation Diminution(1) 30 juin 2025 2024 conversion Indemnités de départ à la retraite 432 47 — — 479 Total provisions - part non 432 47 — — 479 courante Les hypothèses utilisées pour la détermination des indemnités de fin de carrière au 30 juin 2025 demeurent inchangées par rapport aux hypothèses utilisées au 31 décembre 2024. Voir la Note 11 - Engagements de retraite des états financiers consolidés au 31 décembre 2024. 12. Provisions 31 décembre Ecart de (en milliers d’euros) Augmentation Diminution(1) 30 juin 2025 2024 conversion Provisions pour litiges 341 7 (230) — 118 Provisions pour charges 96 42 (90) — 49 Total Provisions - part courante 438 49 (320) — 167 Les provisions pour litiges comprennent exclusivement les litiges sociaux en cours. La diminution nette de 0,2 million d'euros enregistrée au premier semestre 2025 résulte du règlement de litiges. Page 29 13. Dettes financières 13.1 ANALYSE DES DETTES FINANCIÈRES 31 décembre (en milliers d’euros) 30 juin 2025 2024 Dettes de location - part courante 1 247 1 261 Avance remboursable : Prêt BPI - part courante 535 689 Prêt Garanti par l'Etat - Part courante 2 522 2 543 Prêt BEI - part courante 430 430 Total des dettes financières courantes 4 735 4 924 Dettes de location - part non courante 2 385 2 969 Avance remboursable : Prêt BPI - part non courante 759 1 258 Prêt Garanti par l'Etat - Part non courante 307 1 547 Prêt BEI - part non courante 43 054 40 204 Total des dettes financières non courantes 46 505 45 978 Total des dettes financières 51 240 50 902 Le tableau ci-dessous présente le détail des variations des passifs résultant des activités de financement, y compris les variations découlant des flux de trésorerie et les variations non monétaires. Avances de prêt BPI Prêts PGE remboursables Dettes de (en milliers d’euros) Avance Prêt BEI Total location Avance HSBC Bpifrance Curadigm Bpifrance “PGE” “PGE” Bpifrance Au 31 décembre 2024 4 230 1 606 342 1 891 2 198 40 635 50 902 Versement — — — — — — — Baisse des prêts et avances — (600) (75) (626) (626) — (1 927) conditionnelles Intérêts payés (69) — — (11) (22) (233) (335) Paiement des dettes (568) — — — — — (568) locatives Flux de trésorerie utilisés dans les (637) (600) (75) (638) (648) (233) (2 831) activités de financement Engagement de location de — — — — — — — l'exercice Impact de l'actualisation et — 3 8 (4) (1) (1 036) (1 031) coût amorti Cumul des intérêts fixes 38 10 — 11 21 742 822 Cumul des variables — — — — — 3 377 3 377 d'intérêts Flux non-cash des activités 38 13 8 7 19 3 083 3 169 de financement Au 30 Juin 2025 3 632 1 019 275 1 260 1 569 43 484 51 240 Dont Courant 1 247 438 97 1 260 1 262 430 4 735 Dont Non-courant 2 385 581 178 — 307 43 054 46 505 Dettes locatives Les dettes de location correspondent au montant actualisé des loyers à payer sur la durée des contrats de location pour tous les contrats en cours entrant dans le champ d’application de la norme IFRS 16. Pour la période présentée, les principaux contrats concernent les immeubles loués à Paris et à Villejuif. Avance remboursable BPI Page 30 La Société a reçu des avances remboursables de la Banque Publique d’Investissement (“Bpifrance”, anciennement “OSEO Innovation”). Les avances portent un intérêt de 1,56 %. Le remboursement des sommes dues au titre de la période s'élève à 0,6 million d'euros, tandis que le montant à rembourser correspond à 1,0 million d'euros (comme détaillé dans le tableau de la note 13.2 - Échéances des dettes financières des états financiers consolidés intermédiaires résumés non audités inclus dans le présent rapport). En juin 2020, la Société a obtenu une avance conditionnelle de 0.5 million d’euros de Bpifrance, dont 0,4 million d’euros ont été reçus à la date de signature. L’avance est sans intérêt. Le remboursement des sommes dues au titre de la période s'élève à 0,1 million d'euros, tandis que le montant à rembourser correspond à 0,3 million d'euros (comme détaillé dans le tableau de la note 13.2 - Échéances des dettes financières des états financiers consolidés intermédiaires résumés non audités inclus dans le présent rapport). Prêt Garanti par l’État La Société a annoncé en Juin 2020 qu’elle avait reçu l’approbation d’un financement de la part de HSBC et de Bpifrance pour un montant de 5 millions d’euros chacun sous la forme de prêts garantis par l'État ("Prêts Garantis par l'État", ou "PGE" en France). Ce prêt est comptabilisé au coût amorti avec un taux d’intérêt effectif de 0,31%. La période de remboursement de la dette s’étale de septembre 2022 et durera jusqu’à mi-2026. Au 30 juin 2025, 0,6 million d'euros ont été remboursés sur le prêt PGE HSBC. En juillet 2020, la Société a souscrit au second prêt PGE de 5 millions d’euros avec Bpifrance (le ''Prêt PGE Bpifrance''). Le prêt PGE de Bpifrance a une durée de six ans et est garanti à 90 % par l’État français. A compter de la deuxième année de remboursement, le prêt génère des intérêts à un taux de 2,25 % par an, incluant une commission de garantie annuelle de l’État de 1,61 % par an. Le principal et les intérêts du prêt Bpifrance PGE doivent être remboursés en 20 versements trimestriels à partir du 31 octobre 2021 jusqu’au 26 juillet 2026. Au 30 juin 2025, 0,6 million d'euros ont été remboursés sur le prêt PGE Bpifrance. Prêt BEI Au 30 juin 2025, la Société a comptabilisé la dette au coût amorti en utilisant le taux d’intérêt effectif (“TIE”) initial de 21,3% et en ajustant les sorties de flux de trésorerie de la dette estimées conformément aux prévisions révisées du chiffre d'affaires annuel lié au JNJ-1900 (NBTXR3) dans le cadre de l'accord de licence de la Société (montant et échéancier des flux). L’emprunt auprès de la BEI s'élève à 43,5 millions d'euros au 30 juin 2025, contre 40,6 millions d'euros au 31 décembre 2024. L'augmentation de 2,8 millions d'euros sur le premier semestre clos le 30 juin 2025 comprend : • les intérêts courus mais non échus fixes et variables pour un montant de 4,1 millions d'euros, partiellement compensés par • le paiement de 0,2 million d'euros d’intérêts conformément à l'échéancier de remboursement. • l'impact financier positif net de 1,0 million d’euros suite à la revalorisation du prêt BEI, correspondant à : (i) la diminution des sorties de dette estimées au-delà de 2024 (avant effet d'actualisation) de 2,4 millions d'euros d’impact résultat positif, (ii) partiellement compensée par un effet négatif de l'actualisation de 1,4 million d'euros. Au 30 juin 2025, la juste valeur de la dette est estimée à 46,5 millions d'euros. La Société a estimé la juste valeur de la dette en utilisant la même méthodologie que celle utilisée à la date de renégociation. Ce faisant, la Société a conservé la même hypothèse de notation de crédit CCC. Cependant, essentiellement en raison d'une augmentation des spreads observée au 30 juin 2025 (par rapport décembre 2024), le taux d'actualisation moyen représentant les conditions de marché en vigueur au 30 juin 2025 a été estimé à 19,2 %. 13.2 ÉCHÉANCES DES DETTES FINANCIÈRES Les échéanciers de remboursement des dettes financières à leur valeur nominale et incluant les intérêts à taux fixe et les paiements d'intérêts variables futurs ont été estimées sur la base des prévisions relatives aux étapes importantes et aux redevances se présentent comme suit : Page 31 30 juin 2025 À moins Entre 1 Entre 3 À plus TOTAL (en milliers d’euros) d'1 an et 3 ans et 5 ans de 5 ans Bpifrance 442 595 — — 1 037 Avance Curadigm BPI 100 200 25 — 325 taux 0 PGE - HSBC (1) 1 266 — — — 1 266 PGE - Bpifrance (1) 1 275 314 — — 1 589 Emprunt BEI 467 22 027 44 891 30 366 97 751 Dettes de location 1 282 1 707 866 — 3 855 Total 4 831 24 843 45 781 30 366 105 822 (1)La Société prévoit selon les termes contractuels de rembourser les PGE – HSBC et Bpifrance sur une période de 5 ans avec un différé d’amortissement d’un an la première année (dernière mensualité étant en 2026). 31 décembre 2024 À moins Entre 1 Entre 3 À plus TOTAL (en milliers d’euros) d'1 an et 3 ans et 5 ans de 5 ans Bpifrance 800 837 — — 1 637 Avance Curadigm BPI 100 200 75 — 375 taux 0 PGE - HSBC (1) 1 272 631 — — 1 903 PGE - Bpifrance (1) 1 289 948 — — 2 237 Emprunt BEI 467 19 942 40 784 39 196 100 389 Dettes de location 1 282 2 131 866 216 4 495 Total 5 210 24 689 41 725 39 412 111 036 (1)La Société prévoit selon les termes contractuels de rembourser les PGE – HSBC et Bpifrance sur une période de 5 ans avec un différé d’amortissement d’un an la première année (dernière mensualité étant en 2026). Les dettes comprennent le capital et taux d’intérêts fixes et variables de l’avance remboursable, de l’emprunt Bpifrance à taux zéro, du prêt de la BEI, les deux PGE ainsi que les dettes de locations. Ces montants reflètent les montants engagés au titre de ces contrats au 30 juin 2025. Au 30 juin 2025, le tableau ci-dessus indique que le total des sorties de trésorerie prévues (non actualisées) au titre du prêt de la BEI s'élève à 97,8 millions d'euros, dont • 33,7 millions d'euros au titre du principal et des intérêts à taux fixe à payer sur la durée du prêt, • 19 millions d'euros restants à rembourser par anticipation selon les mécanismes suivants : • si la Société obtient des capitaux non dilutifs grâce à la conclusion d'un accord de développement commercial, un remboursement accéléré de ce nouveau paiement d'étape sera déclenché, ce qui entrainera un paiement au prorata du montant reçu, celui-ci ne pourra pas excéder 10% des paiements initiaux ou des paiements d'étapes reçus par la Société; et • si la Société conclut à l’avenir des opérations de financement par capitaux propres ou par dette des remboursements anticipés seront effectués avec un mécanisme égal à un pourcentage bas et progressif à appliquer à ces futures opérations de financement jusqu’à un montant total de 100 millions d’euros, sur une base cumulative, pourcentage qui sera augmenté à un chiffre moyen pour les financements supérieurs à 100 millions d’euros. • et 45,1 millions d'euros au titre du paiement de redevances futures estimées, sur la base des prévisions de ventes attendues générées par les partenaires de la Société au cours de la période de six ans commençant à la commercialisation du JNJ-1900 (NBTXR3). (Voir les notes 4.4 - Convention de financement avec la Banque européenne d'investissement (« BEI ») et 13.1 - Avance conditionnelle, prêt bancaire et prêts du gouvernement et des autorités publiques aux états financiers consolidés préparé conformément aux normes comptables IFRS pour l'exercice clos le 31 décembre 2024). Page 32 14. Fournisseurs, comptes rattachés et autres passifs courants 14.1 FOURNISSEURS ET COMPTES RATTACHES 31 décembre (en milliers d’euros) 30 juin 2025 2024 Factures non parvenues - essais cliniques 7 413 15 550 Autres fournisseurs et comptes rattachés 4 226 4 484 Fournisseurs et comptes rattachés 11 639 20 036 Les dettes fournisseurs ne sont pas actualisées, dans la mesure où les montants n’ont pas d’échéance à plus d’un an. Les factures non parvenues relatives aux essais cliniques ont diminué de 8,1 millions d'euros entre le 31 décembre 2024 et le 30 juin 2025. Cette diminution s’explique principalement par (i) le développement du NANORAY-312 en 2025, qui représente une facture non parvenue de 1,8 million d'euros au 30 juin 2025, contre 11,1 millions d'euros au 31 décembre 2024. Cette réduction reflète l’amendement signé en mars 2025, supprimant les obligations de financement de la Société pour l’étude 312 dans le cadre du transfert de sponsorship à Janssen, partiellement compensé par (ii) le développement de l'étude 1100 en 2025, soit une augmentation de la facture non parvenue à 5,3 millions d'euros au 30 juin 2025, contre 4,4 millions d'euros au 31 décembre 2024. Les autres dettes fournisseurs restent stables entre décembre 2024 et juin 2025. 14.2 AUTRES PASSIFS COURANTS 31 décembre (en milliers d’euros) 30 juin 2025 2024 Dettes fiscales 415 537 Dettes sociales 5 872 6 334 Autres dettes 714 672 Autres passifs courants 7 000 7 543 Les dettes sociales sont principalement constituées des charges sociales et autres dettes salariales, à savoir les retenues patronales relatives aux actions gratuites, aux provisions pour primes et pour congés payés et aux charges sociales associées. Les dettes sociales ont diminué de 0,5 million d’euros au cours du premier semestre 2025, principalement en raison du versement sur le premier semestre des primes provisionnées à la clôture précédente pour 0,9 million d'euros. 14.3 PRODUITS CONSTATES D’AVANCE ET PASSIFS CONTRACTUELS 31 décembre (en milliers d'euros) 30 juin 2025 2024 Produits constatés d’avance 50 61 Passifs de contrats courants 36 172 18 100 Produits constatés d’avance et passifs contractuels 36 222 18 161 Les passifs de contrats part courante sont comptabilisés conformément à la norme IFRS 15. Les passifs contractuels courants ont augmenté de 18,1 millions d'euros pour atteindre 36,2 millions d'euros au 30 juin 2025. Le paiement initial reçu en 2021 de LianBio s'élevait à 16,5 millions d'euros et a été comptabilisé comme un passif contractuel, l'exécution de l'obligation de performance correspondante n'ayant pas encore commencé. Cette augmentation de 18,1 millions d'euros résulte des effets combinés des modifications apportées au contrat de licence Janssen et au contrat de licence Asie (anciennement Lianbio) dans la répartition du prix de transaction contraint (voir Note 16 - Produits des activités ordinaires). Page 33 14.4 PASSIFS DE REMBOURSEMENT 31 décembre (en milliers d'euros) 30 juin 2025 2024 Passifs de remboursement - part non courante 4 105 27 778 Passifs de remboursement - part courante 3 273 7 835 Passifs de remboursement 7 378 35 613 Le passif de remboursement comptabilisé en décembre 2024, reflète l'obligation de remboursement liée aux modifications apportées à l'accord Janssen, signé au quatrième trimestre 2024. Au 30 juin 2025, les passifs de remboursement ont diminué de 28,2 millions d’euros conformément à la modification de l’accord Janssen signé le 17 mars 2025. Ces modifications ont été comptabilisées comme une modification de contrat selon IFRS 15, et ont entraîné une variation du prix de transaction, ainsi qu'une modification de la portée des obligations de performance, comptabilisées comme un rattrapage cumulé dans le compte de résultat consolidé et un passif de remboursement dans l'état consolidé de la situation financière (Note 16 - Produits des activités ordinaires). 15. Instruments financiers inscrits au bilan et effet sur le résultat Analyse des instruments financiers inscrits au bilan et effet sur le résultat 30 juin 2025 Juste valeur Actif et Valeur par le Passifs Juste valeur (en milliers d’euros) comptable au compte de financiers au (1) bilan résultat coût amorti Actifs financiers Immobilisations financières 409 — 409 409 Clients et comptes rattachés 1 837 — 1 837 1 837 Trésorerie et équivalents de trésorerie 28 818 — 28 818 28 818 Total 31 064 — 31 064 31 064 Dettes financières Dettes financières - part non courante 46 505 — 46 505 49 508 Dettes financières - part courante 4 735 — 4 735 4 753 Fournisseurs et comptes rattachés 11 639 — 11 639 11 639 Total 62 879 — 62 879 65 900 La juste valeur des dettes financières courantes et non courantes incluant les prêts, les avances remboursables de Bpifrance, le (1) prêt BEI et les prêts garantis par l’État HSBC et Bpifrance, a été évaluée en utilisant des données non observables de " niveau 3 ", dans la classification IFRS 13 de la juste valeur. Page 34 31 décembre 2024 Juste valeur Actif et Valeur par le Passifs Juste valeur (en milliers d’euros) comptable au compte de financiers au (1) bilan résultat coût amorti Actifs financiers Immobilisations financières 406 — 406 406 Clients et comptes rattachés 2 977 — 2 977 2 977 Trésorerie et équivalents de trésorerie 49 737 — 49 737 49 737 Total 53 120 — 53 120 53 120 Dettes financières Dettes financières - part non courante 45 978 — 45 978 48 443 Dettes financières - part courante 4 924 — 4 924 4 924 Fournisseurs et comptes rattachés 20 035 — 20 035 20 035 Total 70 936 — 70 936 73 402 (1) La juste valeur des dettes financières courantes et non courantes incluant les prêts, les avances remboursables de Bpifrance, le prêt BEI et les prêts garantis par l’État HSBC et Bpifrance, a été évaluée en utilisant des données non observables de " niveau 3 ", dans la classification IFRS 13 de la juste valeur. Gestion des risques financiers Les principaux instruments financiers détenus par la Société sont classés en trésorerie et équivalents de trésorerie. L’objectif de la gestion de ces instruments est de permettre le financement des activités de la Société. La politique de la Société est de ne pas utiliser d’instruments financiers à des fins de spéculation. La Société n’utilise pas d’instrument financier dérivé. Les risques financiers principaux auxquels la Société est exposée sont les risques de liquidité, de change, de crédit et de taux d’intérêt. Risque de liquidité Le risque de liquidité découle des engagements financiers de la Société et des dépenses importantes liées au développement et à la fabrication de produits nanotechnologiques et à la réalisation d'études cliniques. Les activités de la Société ont consommé des liquidités importantes depuis sa création. Le développement de produits candidats, y compris la conduite d'essais cliniques, est coûteux, long et risqué, et la Société prévoit de continuer à subir des pertes importantes à court terme. Par conséquent, la Société continuera d'avoir besoin de capitaux supplémentaires substantiels pour poursuivre ses activités de développement clinique et, potentiellement, se lancer dans des activités de commercialisation. La gestion du risque de liquidité vise à garantir que la Société dispose de liquidités et de ressources financières suffisantes pour faire face à ses obligations présentes et futures. La Société établit des prévisions de trésorerie à court terme et des prévisions de flux de trésorerie opérationnels annuels dans le cadre de ses procédures budgétaires. Une gestion prudente du risque de liquidité implique de maintenir des liquidités suffisantes, d'avoir accès à des ressources financières par le biais de facilités de crédit appropriées et de pouvoir dénouer des positions de marché. À la date des présents états financiers consolidés, la Société estime, compte tenu de sa structure de coûts actuelle et de ses engagements de dépenses prévisionnels, être en mesure de financer ses activités jusqu'à mi-2026 (voir Note 2. – Informations générales, déclaration de conformité et base de présentation pour plus de détails). Risque de change La monnaie fonctionnelle de Nanobiotix S.A. est l’euro. L’exposition au risque de change résulte principalement de certains de ses revenus et des comptes bancaires libellés en dollars américains. Dans le cadre de l'Accord Janssen, et l'accord de licence Asie (ancien contrat LianBio), la Société a reçu des paiements en dollars américains. Page 35 En outre, la Société est également exposée par le biais de transactions intragroupes entre Nanobiotix S.A. et sa filiale américaine, pour lesquelles la monnaie fonctionnelle est le dollar américain, ainsi que par des relations commerciales avec des clients et des fournisseurs en dehors de la zone euro. À ce stade de son développement, la Société n'a pas mis en place d’instrument de couverture pour protéger son activité contre les fluctuations des taux de change. Toutefois, une augmentation significative de son activité commerciale en dehors de la zone euro pourrait entraîner une exposition accrue au risque de change, les besoins en fonds de roulement de la Société étant principalement libellés en euros. Dans ce cas, elle pourrait mettre en place une politique de couverture adaptée à ces risques. Risque de crédit Le risque de crédit provient de la trésorerie et des équivalents de trésorerie, des instruments financiers dérivés et des dépôts auprès des banques et d’autres établissements financiers, ainsi que des expositions liées au crédit client, notamment les créances non réglées et aux engagements opérationnels. Le risque de crédit lié à la trésorerie, aux équivalents de trésorerie et aux instruments financiers courants n’est pas significatif au regard de la notation et de la taille des établissements financiers cocontractants. L'exposition de la Société au risque de crédit provient principalement des créances commerciales liées à son client (Janssen) au 30 juin 2025. En raison du nombre limité de clients, la Société surveille de manière appropriée ses créances ainsi que leur paiement et leur apurement. La société ne conclut de telles transactions qu'avec des contreparties très réputées et financièrement saines. Risque de taux d’intérêt L’exposition de la Société au risque de taux d’intérêt concerne principalement les équivalents de trésorerie et les titres de placement, à savoir des dépôts à terme. Les variations de taux d’intérêt ont une incidence directe sur le taux de rémunération de ces placements et les flux de trésorerie générés. Au 30 juin 2025, les emprunts émis par la Société sont exclusivement des emprunts à taux fixe et notre exposition au risque de taux et de marché est donc jugée faible. Les intérêts variables sur le prêt de la BEI sont basés sur des redevances et ne sont pas soumis aux risques de taux du marché. 16. Produits des activités ordinaires Les principes comptables de reconnaissance des revenus utilisés pour préparer les états financiers consolidés résumés intermédiaires non audités pour le semestre clos le 30 juin 2025 sont identiques à ceux utilisés pour l’exercice clos le 31 décembre 2024, comme indiqué ci-dessous. Suite aux accords signés au quatrième trimestre 2024 détaillant les modalités de transfert du sponsorship de l'essai pivot de phase 3 NANORAY-312 en cours dans le cancer de la tête et du cou à Janssen (voir Note 16 - Produits des activités ordinaires des états financiers consolidés au 31 décembre 2024), la Société a signé un avenant avec Janssen le 17 mars 2025. L'avenant prévoit que Janssen assumera la quasi-totalité des coûts restants de l'essai pivot de phase 3 en cours jusqu'à son achèvement, à l'exception d'une partie limitée des coûts qui continueront d'être couverts par la Société. Cet avenant vise à améliorer la liquidité à court terme de la Société en : • réduisant son obligation sur des paiements probables à effectuer à court terme au titre des coûts de développement de l'essai pivot de phase 3 NANORAY-312 en cours ; et • révisant des futurs paiements d'étape potentiels pour un total de 105 millions de dollars au titre du Contrat de licence Janssen et du Contrat de Licence Asie. Cet avenant a été considéré et comptabilisé comme une modification de contrat selon la norme IFRS 15, modifiant les prix de transaction restants du Contrat de licence Janssen et du Contrat de Licence Asie, initialement traités comme des contrats distincts aux fins de la norme IFRS 15. Compte tenu des interdépendances de prix entre les deux effets de l'amendement, comme décrit ci-dessus, la modification de contrat a été appliquée aux deux contrats. Page 36 L'amendement ne modifie pas le périmètre des contrats initiaux, mais l’impact global de la modification de contrat est une augmentation significative du prix de transaction contraint restant des contrats combinés (Contrat Janssen et Contrat de Licence Asie), tandis que les obligations de performance des paiements d’étape demeurent inchangées. L'impact positif net sur le prix de transaction contraint du Contrat Janssen a été comptabilisé comme un ajustement de rattrapage cumulé, les biens ou services restants au titre du contrat de licence n'étant pas distincts. En conséquence, le chiffre d'affaires du semestre clos le 30 juin 2025 inclut un impact positif ponctuel de 21,2 millions d'euros, directement attribuable à la modification du contrat décrite ci-dessus. Conformément à la norme IFRS 15, l'obligation de financement envers Janssen a été réduite à un passif de remboursement net s'élevant à 7,4 millions d'euros au 30 juin 2025. Voir la Note 14.4 – Passifs de remboursement. Les effets combinés de la modification sur les deux contrats de licence ont également entraîné l'affectation de 18,1 millions d'euros du prix de transaction contraint au contrat de licence Asie, qui a été comptabilisé comme passif contractuel connexe, l'exécution de l'obligation de performance correspondante n'ayant pas encore commencé. Voir la Note 14.3 – Produits constatés d'avance et passifs contractuels. Analyse du chiffre d’affaires et autres produits d’exploitation Le tableau ci-après résume le chiffre d’affaires et autres produits d’exploitation de la Société durant les premiers semestres 2025 et 2024 : (en milliers d’euros) 30 juin 2025 30 juin 2024 Services 21 522 3 787 Autres ventes 3 406 2 376 Total Chiffre d’affaires 24 928 6 163 Crédit d’impôt recherche 1 616 2 334 Subventions 67 36 Autres produits 26 756 Total Autres produits d’exploitation 1 710 3 126 Total Chiffre d’affaires et Autres produits d’exploitation 26 638 9 289 Total du chiffre d’affaires Au 30 juin 2025, le chiffre d'affaires total a atteint 24,9 millions d'euros, composé des éléments suivants : • Revenus de “Services” incluant (i) un produit ponctuel de 21,2 millions d'euros directement attribuable à l'impact de la modification contractuelle ayant eu lieu sur le semestre clos le 30 juin 2025, venant compenser l'impact du chiffre d’affaire négatif constaté sur l'exercice 2024: les avenants signés au cours du dernier trimestre 2024 avaient significativement réduit le prix de transaction du contrat de licence, car l’obligation de performance de service R&D avait été remplacée par une obligation de financement de la Société vis-à-vis de Janssen, alors que l'avenant signé en mars 2025 n'a pas modifié le périmètre des obligations de performance de la Société, mais a augmenté le prix de transaction restant de l’accord global de licence, (ii) et d'autres produits de services liés à la refacturation du transfert de technologie et d'assistance technique à Janssen pour un montant de 0,4 million d'euros. • “Autres ventes” s’élevant à 3,4 millions d'euros liés aux fournitures cliniques de produits à Janssen pour le semestre clos le 30 juin 2025. Pour le semestre clos le 30 juin 2024, le chiffre d’affaires de la Société de 6,2 millions d'euros comprend principalement (i) le chiffre d'affaires «Services» lié au transfert de la licence à Janssen et aux services de R&D rendus au prorata de l'achèvement des études en cours, pour un montant total de 2,7 millions d'euros ; (ii) le revenu de “Services” lié à la refacturation du transfert de technologie et d'assistance technique pour 1,1 million d’euros ; (iii) et le montant de 2,4 million d'euros d'« Autres ventes » liées à l’approvisionnement en produits cliniques à Janssen. Crédit d'impôt recherche Le crédit d'impôt recherche est passé de 2,3 millions d’euros en 2024 à 1,6 million d’euros en 2025, principalement en raison de l’exclusion d’un fournisseur majeur du périmètre du CIR en 2025. Subventions Page 37 Les subventions comprennent le Bpifrance Deep Tech Grant reçu par la Société dont 67 milliers d'euros ont été comptabilisés en autres produits sur le semestre clos le 30 juin 2025, contre 36 milliers d'euros au titre du semestre clos le 30 juin 2024. Autres Le poste « Autres » comprend principalement des produits pour refacturation de services, dans le cadre du « GTCA » pour un montant total de 26 milliers d'euros au 30 juin 2025 contre 0,5 million d'euros pour la refacturation de services et 0,2 M€ pour les prestations de fournitures au 30 juin 2024. Page 38 17. Charges opérationnelles 17.1 FRAIS DE RECHERCHE ET DE DEVELOPPEMENT (en milliers d’euros) 30 juin 2025 30 juin 2024 Achats, sous-traitance et autres charges (7 489) (15 105) Charges du personnel (dont paiements fondés sur des actions) (6 430) (6 199) Amortissements et provisions (1) (610) (682) Total des frais de recherche et de développement (14 529) (21 987) (1) voir Note 17.4 - Amortissements et provisions. Les achats, la sous-traitance et les autres dépenses de R&D ont diminué de 7,6 millions d’euros pour le semestre clos le 30 juin 2025 par rapport à la même période en 2024. Cet écart favorable est principalement lié au transfert du sponsorship de l’étude 312 à Janssen, incluant la modification de l’accord Janssen signé en mars 2025, entraînant la suppression des obligations de financement sur l’étude 312. Les charges de personnel de R&D ont augmenté de 0,2 million d’euros, soit de 3.7 % pour le semestre clos le 30 juin 2025 par rapport à la même période en 2024, qui s'explique principalement par l'étalement des charges sociales liées à l'attribution d'options d'achat d'actions entre 2025 et 2024 pour 0,2 million d'euros. 17.2 FRAIS COMMERCIAUX, GENERAUX ET ADMINISTRATIFS (en milliers d’euros) 30 juin 2025 30 juin 2024 Achats, honoraires et autres charges (4 334) (4 183) Charges du personnel (dont paiements fondés sur des actions) (7 040) (6 336) Amortissements et provisions (1) 80 (301) Total des frais commerciaux, généraux et admin. (11 294) (10 819) (1) voir Note 17.4 Amortissements et provisions. Les achats, honoraires et autres dépenses ont augmenté de 0,2 million d’euros pour le semestre clos le 30 juin 2025 par rapport à la même période en 2024, les dépenses SG&A ayant été étroitement surveillées et sont restées relativement stables à celles de l'année précédente. Les charges de personnel de SG&A ont augmenté de 0,7 million d’euros, soit de 11,1%, pour le semestre clos le 30 juin 2025 par rapport à la même période en 2024. Cette variation s'explique principalement par l'étalement des charges sociales liées à l'attribution d'options de souscription d'actions pour 0,3 million d’euros, et par des indemnités de départ suite à une réaffectation de ressources pour 0,2 million d’euros. Les charges d'amortissement des SG&A ont diminué de 0,4 million d’euros suite à la reprise de provision constatée au cours du premier semestre 2025 suite aux règlements des litiges. 17.3 CHARGES DE PERSONNEL (en milliers d’euros) 30 juin 2025 30 juin 2024 Salaires (7 182) (7 238) Charges sociales (4 088) (3 324) Paiements fondés sur des actions (2 161) (1 940) Engagements de retraite (40) (33) Total des charges du personnel (13 470) (12 535) Effectifs moyens 104 105 Effectifs en fin de période 103 110 Page 39 Au 30 juin 2025, la Société compte 103 collaborateurs, dont 72 en R&D et 31 en frais commerciaux, généraux et administratifs contre 110 au 30 juin 2024 dont 77 en R&D et 33 en frais commerciaux, généraux et administratifs. Les salaires sont restés stables au cours du semestre clos le 30 juin 2025 par rapport à la même période en 2024. Au premier semestre 2025, les charges sociales y afférentes ont augmenté de 22,9 %, soit de 0,8 million d'euros, principalement en raison de l'étalement des charges sociales liées à l'attribution d'options d'achat d'actions pour 0,5 million d'euros. Conformément à la norme IFRS 2 – « Paiements fondés sur des actions », le poste « Paiements fondés sur des actions » figurant dans le compte de résultat consolidé correspond à l’amortissement de la juste valeur des plans d’options octroyés par la Société au cours de l’exercice. Les charges relatives aux paiements fondés sur des actions s'établissent à 2,2 million d’euros au 30 juin 2025, contre 1,9 million d’euros au 30 juin 2024 (voir Note 18 - Paiements fondés sur des actions). 17.4 AMORTISSEMENTS ET PROVISIONS Le tableau ci-dessous présente les amortissements et provisions analysés par fonction : 30 juin 2025 Frais Frais de commerciaux, (en milliers d'euros) recherche et Total généraux et développement administratifs Amortissement des immobilisations incorporelles (2) (1) (2) Amortissement des immobilisations corporelles (645) (152) (798) Utilisation des provisions pour litiges et charges 80 240 320 Dotation des provisions pour litiges et charges (43) (7) (49) Total des amortissements et provisions (610) 80 (529) Total des provisions d'engagements de retraite (IAS 19) (1) (27) (13) (40) Total des amortissements et provisions (637) 68 (569) (1) Les détails de la provision pour obligations au titre des prestations de retraite sont fournis dans la Note 11 30 juin 2024 Frais Frais de commerciaux, (en milliers d'euros) recherche et Total généraux et développement administratifs Amortissement des immobilisations incorporelles (1) — (2) Amortissement des immobilisations corporelles (621) (164) (785) Utilisation des provisions pour litiges et charges — 14 14 Dotation des provisions pour litiges et charges (60) (150) (210) Total des amortissements et provisions (682) (301) (983) Total des provisions d'engagements de retraite (IAS 19) (1) (23) (10) (33) Total des amortissements et provisions (705) (311) (1 016) (1) Les détails de la provision pour obligations au titre des prestations de retraite sont fournis dans la Note 11 17.5 AUTRES PRODUITS ET CHARGES OPERATIONNELS 30 juin 2025 30 juin 2024 (en milliers d'euros) Autres charges non récurrentes (12) (137) Autres produits non récurrents 5 3 Total des autres produits et charges opérationnels (7) (134) Au 30 juin 2025, la Société n'a pas enregistré d’autres produits et charges non récurrents significatifs. Page 40 Au 30 juin 2024, les autres charges non récurrentes concernent principalement des indemnités de licenciement pour un montant de 129 milliers d'euros. Page 41 18. Paiements fondés sur des actions Analyse des paiements fondés sur des actions Des options sur actions (OSA), des bons de souscription de parts de créateur d’entreprise (BSPCE), des bons de souscription d’actions (BSA) et des attributions gratuites d’actions (AGA) ont été attribués aux dirigeants et employés, ainsi qu’aux membres du Conseil de Surveillance et à des consultants du Groupe. Dans certains cas, l’exercice des options sur actions, des bons de souscription de parts de créateur d’entreprise et des bons de souscription d'actions est subordonnée à des conditions de performance. La Société n’est tenue par aucune obligation contractuelle ou implicite de régler les options en numéraire. Le nombre de BSPCE, BSA, OSA et AGA en circulation au 30 juin 2025 et leurs principales caractéristiques sont détaillés ci-après : Plans de BSPCE en circulation au 30 juin 2025 : BSPCE 2015-1 BSPCE 2015-3 BSPCE 2016 O BSPCE 2016 P BSPCE 2017 O BSPCE 2017 P Date(s) d'assemblée(s) 18-juin-14 18-juin-14 25-juin-15 25-juin-15 23-juin-16 23-juin-16 Date d'attribution par le Directoire 10-févr.-15 10-juin-15 2-févr.-16 2-févr.-16 7-janv.-17 7-janv.-17 Nombre total de BSPCE autorisés 450 000 450 000 450 000 450 000 450 000 450 000 Nombre total de BSPCE attribués 71 650 53 050 126 400 129 250 117 650 80 000 Nombre total d'actions pouvant être souscrites 71 650 53 050 126 400 129 250 117 650 80 000 dont le nombre pouvant être souscrites ou achetées par les mandataires sociaux: 24 000 0 23 500 23 500 26 400 32 000 dont le nombre pouvant être souscrites ou achetées par Laurent LEVY 24 000 0 23 500 23 500 26 400 32 000 Nombre de bénéficiaires non mandataires 13 42 43 50 42 3 Point de départ de l'exercice des BSPCE 10/02/2016 10/06/2016 02/02/2017 02/02/2016 07/01/2017 07/01/2017 Date d'expiration des BSPCE 10/02/2025 10/06/2025 02/02/2026 02/02/2026 07/01/2027 07/01/2027 Prix d'exercice des BSPCE 18,57 € 20,28 € 14,46 € 14,46 € 15,93 € 15,93 € Nombre d'actions souscrites à la date du document — — 333 — — 0 Nombre total de BSPCE annulés ou caducs à la date du document 71 650 53 050 29 250 31 150 20 600 0 Nombre total de BSPCE restants à la date du document — — 96 817 98 100 97 050 80 000 Nombre total d'actions pouvant être souscrites à la date du document — — 96 817 98 100 97 050 80 000 Nombre total maximum d'actions pouvant être souscrites lors de l'exercice de tous les BSPCE en circulation (en supposant que toutes les conditions d'exercice — — 96 817 98 100 97 050 80 000 desdites BSPCE soient remplies) Page 42 Plans de BSA en circulation au 30 juin 2025 : BSA 2015-1 BSA 2015-2 (a) BSA 2018-2 BSA 2019-1 BSA 2020 BSA 2021 (a) Date(s) d'assemblée(s) 18-juin-14 18-juin-14 23-mai-18 23-mai-18 11-avr.-19 30-nov.-20 Date d'attribution par le Directoire 10-févr.-15 25-juin-15 27-juil.-18 29-mars-19 17-mars-20 20-avr.-21 Nombre total de BSA autorisés 100 000 100 000 140 000 140 000 500 000 650 000 Nombre total de BSA attribués 26 000 64 000 5 820 18 000 18 000 48 103 Nombre total d'actions pouvant être souscrites 26 000 64 000 5 820 18 000 18 000 48 103 dont le nombre pouvant être souscrites ou achetées par les mandataires sociaux: 15 000 — — 12 700 14 024 — Anne-Marie GRAFFIN 5 000 — — 2 900 3 843 — Enno SPILLNER 3 000 — — 4 000 3 829 — Alain HERRERA 5 000 — — 2 900 3 195 — Gary PHILLIPS — — — — — — Nombre de bénéficiaires non mandataires 2 1 1 1 1 1 Point de départ de l'exercice des BSA 10/02/2015 25/06/2015 27/07/2018 29/03/2019 17/03/2020 20/04/2021 Date d'expiration des BSA 10/02/2025 25/06/2025 27/07/2028 29/03/2029 17/03/2030 20/04/2031 Prix d'émission des BSA 4,87 € 5,00 € 2,36 € 1,15 € 0,29 € 2,95 € Prix d'exercice des BSA 17,67 € 19,54 € 16,10 € 11,66 € 6,59 € 13,47 € Nombre d'actions souscrites à la date du document — — — — — — Nombre total de BSA annulés ou caducs à la date du document 26 000 64 000 — — — 33 672 Nombre total de BSA restants à la date du document — — 5 820 18 000 18 000 14 431 Nombre total d'actions pouvant être souscrites à la date du document — — — — — — Nombre total maximum d'actions pouvant être souscrites lors de l'exercice de tous les BSA en circulation (en supposant que toutes les conditions d'exercice desdites — — 5 820 18 000 18 000 14 431 BSA soient remplies) Page 43 Plans des OSA en circulation au 30 juin 2025 : OSA 2021-04 OSA 2016-1 P OSA 2016-2 OSA 2017 O OSA 2018 OSA 2019-1 OSA 2019 LLY OSA 2020 O Date(s) d'assemblée(s) 25-juin-15 23-juin-16 23-juin-16 14-juin-17 23-mai-18 11-avr.-19 11-avr.-19 30-nov.-20 Date d'attribution par le Directoire 2-févr.-16 3-nov.-16 7-janv.-17 6-mars-18 29-mars-19 24-oct.-19 11-mars-20 20-avr.-21 Nombre total de OSA autorisés 450 000 450 000 450 000 526 800 648 000 500 000 500 000 850 000 Nombre total de OSA attribués 6 400 4 000 3 500 62 000 37 500 500 000 407 972 143 200 Nombre total d'actions pouvant être souscrites 6 400 4 000 3 500 62 000 37 500 500 000 407 972 143 200 dont le nombre pouvant être souscrites ou achetées par les mandataires sociaux: — — — — — 500 000 180 000 — dont le nombre pouvant être souscrites ou achetées par Laurent LEVY — — — — — 500 000 120 000 — dont le nombre pouvant être souscrites ou achetées par Anne- Juliette HERMANT — — — — — — 60 000 — dont le nombre pouvant être souscrites ou achetées par Bart VAN RHIJN — — — — — — — — dont le nombre pouvant être souscrites ou achetées par Louis Kayitalire — — — — — — — — Nombre de bénéficiaires non mandataires 2 1 2 5 12 — 104 13 Point de départ de l'exercice des OSA 02/02/2017 03/11/2017 08/01/2018 07/03/2019 30/03/2021 24/10/2019 11/03/2021 20/04/2022 Date d'expiration des OSA 02/02/2026 03/11/2026 07/01/2027 06/03/2028 29/03/2029 24/10/2029 11/03/2030 20/04/2031 Prix d'exercice des OSA 13,05 € 14,26 € 14,97 € 12,87 € 11,08 € 6,41 € 6,25 € 13,74 € Nombre d'actions souscrites à la date du document — — — — — — — — Nombre total de OSA annulés ou caducs à la date du document 6 000 — 3 000 12 000 12 750 — 47 265 104 668 Nombre total de OSA restants à la date du document 400 4 000 500 50 000 24 750 500 000 360 707 38 532 Nombre total d'actions pouvant être souscrites à la date du document 400 4 000 500 50 000 24 750 — 360 707 38 532 Nombre total maximum d'actions pouvant être souscrites lors de l'exercice de tous les OSA en circulation (en supposant que 400 4 000 500 50 000 24 750 500 000 360 707 38 532 toutes les conditions d'exercice desdites OSA soient remplies) Page 44 OSA 2021-04 OSA 2021-06 OSA 2021-06 OSA 2022 06 OSA 2022 06 OSA 2025-01 OSA 2025-02 OSA 2023 O OSA 2024 O P P O P O O O Date(s) d'assemblée(s) 30-nov.-20 30-nov.-20 28-avr.-21 30-nov-20 28-avr-21 27-juin-23 27-juin-23 28-mai-24 28-mai-24 Date d'attribution par le Directoire 20-avr.-21 21-juin-21 21-juin-21 22-juin-22 22-juin-22 20-juil-23 23-mai-24 18-fev-25 16-mai-25 Nombre total de OSA autorisés 1 000 000 1 000 000 850 000 1 000 000 850 000 1 700 000 1 700 000 1 700 000 1 700 000 Nombre total de OSA attribués 428 000 60 000 60 000 170 400 410 500 338 860 1 224 780 8 000 1 241 005 Nombre total d'actions pouvant être souscrites 428 000 60 000 60 000 170 400 410 500 338 860 1 224 780 8 000 1 241 005 dont le nombre pouvant être souscrites ou achetées par les mandataires sociaux: 240 000 60 000 60 000 — 245 000 298 860 930 000 — 945 000 dont le nombre pouvant être souscrites ou achetées par Laurent LEVY 180 000 — — — 150 000 200 116 500 000 — 505 000 dont le nombre pouvant être souscrites ou achetées par Anne-Juliette HERMANT 60 000 — — — 35 000 33 354 90 000 — 100 000 dont le nombre pouvant être souscrites ou achetées par Bart VAN RHIJN — 60 000 60 000 — 60 000 65 390 180 000 — 190 000 dont le nombre pouvant être souscrites ou achetées par — — — — — — 160 000 — 150 000 Louis KAYITALIRE Nombre de bénéficiaires non mandataires 14 — — 83 49 2 107 2 105 Point de départ de l'exercice des OSA 20/04/2022 21/06/2022 21/06/2022 22/06/2023 22/06/2023 20/7/2023 23/05/2024 18/02/2025 16/05/2025 Date d'expiration des OSA 20/04/2031 21/06/2031 21/06/2031 22/06/2032 22/06/2032 20/7/2033 23/05/2034 18/02/2035 16/05/2035 Prix d'exercice des OSA 13,74 € 12,99 € 12,99 € 4,16 € 4,16 € 5,00 € 5,81 € 3,36 € 2,97 € Nombre d'actions souscrites à la date du document — — — — — — — — — Nombre total de OSA annulés ou caducs à la date du document 87 400 — — 46 620 30 500 20 000 5 250 — 1 Nombre total de OSA restants à la date du document 340 600 60 000 60 000 123 780 380 000 318 860 1 219 530 8 000 1 241 004 Nombre total d'actions pouvant être souscrites à la date du document — — 60 000 — 380 000 106 288 406 510 — — Nombre total maximum d'actions pouvant être souscrites lors de l'exercice de tous les OSA en circulation (en supposant que toutes les conditions d'exercice desdites 340 600 60 000 60 000 123 780 380 000 318 860 1 219 530 8 000 1 241 004 OSA soient remplies) Page 45 Plans d’AGA en circulation au 30 juin 2025 : AGA 2023 - P1 AGA 2023 - P2 Date(s) d'assemblée(s) 27-Jun-23 27-Jun-23 Date d'attribution par le Directoire 27-Jun-23 27-Jun-23 Nombre total de AGA autorisés 1 200 000 1 200 000 Nombre total de AGA attribués 427 110 439 210 Nombre total d'actions pouvant être souscrites 427 110 439 210 dont le nombre pouvant être souscrites ou achetées par les mandataires sociaux: 298 860 293 470 dont le nombre pouvant être souscrites ou achetées par Laurent LEVY 200 116 200 116 dont le nombre pouvant être souscrites ou achetées par Anne-Juliette HERMANT 33 354 33 354 dont le nombre pouvant être souscrites ou achetées par Bart VAN RHIJN 65 390 65 390 Nombre de bénéficiaires non mandataires 88 87 Date d'acquisition (fin de la période d'acquisition) 27/06/2025 27/06/2025 Nombre d'actions souscrites à la date du document 392 060 417 760 Nombre total de AGA annulés ou caducs à la date du document 35 050 21 450 Nombre total de AGA restants à la date du document — — Nombre total d'actions pouvant être souscrites à la date du document — — Durée de la période de conservation 1 année 1 année Page 46 BSPCE BSA OSA Total Nombre total de titres en circulation au 30 371 967 56 251 4 730 663 5 158 881 juin 2025 Les méthodes d’évaluation utilisées pour estimer la juste valeur des options d’achat d’actions et des bons de souscription d’actions sont décrites ci-après : • Le prix d’exercice est basé sur le prix de l’action à la date d’attribution, • Le taux sans risque a été déterminé en fonction de la durée de vie moyenne des instruments; et • La volatilité a été déterminée sur la base d'un échantillon de sociétés cotées du secteur des biotechnologies à la date d’attribution et pour une durée égale à la durée du bon de souscription ou de l’option. Les conditions de performance de tous les plans ont été évaluées comme suit : • les conditions de performance non liées au marché ont été analysées afin de déterminer la date probable d’exercice des bons de souscription et des options, et la dépense associée a été enregistrée en fonction de la probabilité que ces conditions se réalisent; et • les conditions de performance liées au marché ont été directement incluses dans le calcul de la juste valeur des instruments. Au 30 juin 2025, le détail des plans de paiement fondés sur des actions ayant une charge IFRS 2 restante est présenté dans les tableaux ci-dessous, reflétant les hypothèses concernant la probabilité que les conditions de performance non liées au marché soient remplies et l'impact comptable continu pour la période. Valeur Charge au Charge au Cours de Prix Taux initiale du 30.06.2025 Taux de 30.06.2024 Plan l’action d’exercice Volatilité Maturité sans plan rendement (en milliers (en milliers (en milliers (en euros) (en euros) risque d’euros) d’euros) d’euros) 38,9 % - 0,38 % / 5,5 / 6/ OSA 2021-04 O 13.6 13.74 37,8 % - 0,33 % / 0,00 % 684 — (4) 6,5 38,3 % 0,28 % OSA 2021-04 P 13,60 13,74 39,10 % 10 0,03% 0,00% 1 816 48 77 39,2 % - 0,35 % / 5,5 / OSA 2021-06 O 12.2 12.99 37,9 % - 0,30 % / 0,00 % 246 13 6 /6,5 38,1 % 0,26 % OSA 2021-06 P 12,20 12,99 39,10 % 10 0,13% 0,00% 212 12 12 OSA 2022-06 P 3.68 4.16 0.4008 10 0.0228 0,00 % 71 — 2 42,06 % - 1,83 % / 5,5 / OSA 2022-06 O 3.68 4.16 41,21 % - 1,87 % / 0,00 % 580 23 57 6 /6,5 40,65 % 1,90 % 45,07 % - 2,85 % / 44,11 % - 6,0 5,5 / OSA 2023-01 O 6.75 5 2,83 % / 0,00 % 1 255 164 357 / 6,5 43,41 % 2,82 % 53,30 % - 3,00 % / 51,90 % - 5,9 5,4 / OSA 2024-01 O 5.19 5.81 3,02 % / 0,00 % 3 107 837 194 / 6,4 50,70 % 3,02 % 47,18 % / 2,83 % / 47,43 % / 5,9 5,4 / OSA 2025-01 O 3.65 3.36 2,91 % / 0,00 % 15 3 — / 6,4 47,57 % 2,98 % 47,56 % / 2,53 % / 47,32 % / 5,9 5,4 / OSA 2025-02 O 3.74 2.97 2,61 % / 0,00 % 2 523 186 — / 6,4 47,43 % 2,70 % Total OSA n.a. n.a. n.a. n.a. n.a. n.a. n.a. 1 273 708 Page 47 Valeur Charge au Charge au Cours de Prix initiale du 30.06.2025 Taux sans Taux de 30.06.2024 Plan l’action d’exercice Volatilité Maturité plan risque rendement (en milliers (en milliers (en milliers (en euros) (en euros) d’euros) d’euros) d’euros) 3 % / 3,2 AGA 2023 - P1 4.87 0 n.a. n.a. 0,00 % 2 071 446 472 % 3 % / 3,2 AGA 2023 - P2 4.87 0 n.a. n.a. 0,00 % 2 130 442 507 % Total AGA n.a. n.a. n.a. n.a. n.a. n.a. n.a. 888 1 232 (en milliers d’euros) BSPCE BSA OSA AGA Total Charge au 30 juin 2025 — — 1 273 888 2 161 (en milliers d’euros) BSPCE BSA OSA AGA Total Charge au 30 juin 2024 — — 708 1 232 1 940 Page 48 19. Résultat financier (en milliers d'euros) 30 juin 2025 30 juin 2024 Revenus sur trésorerie et équivalents de trésorerie 598 1 499 Gains de change 47 1 888 Total des produits financiers 645 3 386 Charges d’intérêts (4 174) (3 772) Impact net de l'évaluation, de l'actualisation et de catch-up sur la dette BEI 1 036 2 722 Charges d’intérêts IFRS 16 (69) (89) Pertes de change (3 624) (324) Total des charges financières (6 831) (1 463) Résultat financier (6 186) 1 924 Revenus de la trésorerie et des équivalents de trésorerie Pour le semestre clos le 30 juin 2025, le revenu de 0,6 million d'euros sur la trésorerie et équivalents de trésorerie est lié aux dépôts à court terme contre 1,5 million d'euros pour la période de six mois close le 30 juin 2024. Charges d’intérêts Pour le semestre clos le 30 juin 2025, les charges d'intérêts s'élèvent à 4,2 millions d'euros, principalement expliqués par les intérêts calculés sur le prêt BEI (voir Note 13 - Dettes financières), correspondant à la somme des intérêts à taux fixes et variables de la BEI pour 4,1 millions d'euros. Pour le semestre clos le 30 juin 2024, les charges d'intérêts s'élèvent à 3,8 millions d'euros, principalement expliqués par les intérêts calculés sur le prêt BEI correspondant à la somme des intérêts à taux fixes et variables de la BEI pour 3,7 millions d'euros. Impact net de l'évaluation, de l'actualisation et de catch-up sur la dette BEI Pour le semestre clos le 30 juin 2025, l’impact net positif de l'actualisation et de catch-up suite à la revalorisation du prêt de la BEI s'élève à 1,0 million d'euros, correspondant à (i) la diminution des sorties de dette estimées au-delà de 2024 - avant effet d'actualisation - se traduisant par un effet positif de 2,4 millions d'euros sur le résultat, (ii) partiellement compensée par un effet négatif de l’actualisation de 1,4 million d'euros, (voir note 13 - Dettes financières). Pour le semestre clos le 30 juin 2024, l'impact financier net positif de la revalorisation du prêt de la BEI de 2,7 millions d'euros correspondant à la variation de l'effet d'actualisation de 13,5 millions d'euros partiellement compensé par l'augmentation des sorties de dette estimées au-delà de 2023 - avant effet d'actualisation - de 10,8 millions d'euros, en raison des prévisions révisées du chiffre d'affaires net et des prévisions révisées des paiements initiaux et d'étape, en raison de la prise en compte de l'accord de licence signé avec Janssen signé le 7 juillet 2023. (Voir Note 13 - Dettes financières). Gains et pertes de change Pour la période de six mois close le 30 juin 2025, la Société a subi une perte de change nette de 3,6 millions d'euros, principalement liée aux dépôts à court terme en USD pour 3,5 millions d'euros. Pour le semestre clos le 30 juin 2024, la Société a subi des gains de change nets de 1,6 millions d'euros, principalement liés aux dépôts à court terme réalisés en dollars américains pour 1,1 millions d’euros et à l’appréciation du dollar sur le compte bancaire HSBC libellé en dollars américains pour 0,5 million d'euros. 20. Information sectorielle Conformément à IFRS 8 - Secteurs opérationnels, la présentation d’informations par secteur opérationnel repose sur l’organisation interne des activités de la Société. Elle reflète le point de vue de la direction et se base sur le reporting interne utilisé par les décideurs opérationnels, à savoir le directeur général et les présidents du directoire et du conseil de surveillance, pour affecter les ressources et évaluer la performance sur ces secteurs opérationnels. Page 49 La Société est présente dans un seul secteur opérationnel, à savoir la recherche et le développement de produits candidats qui exploitent les principes de la physique pour transformer le traitement du cancer. Le revenu net positif, tel que décrit en Note 16 – Produits des Activités Ordinaires, est reconnu principalement par la Société vis-à-vis d’un client principal, Janssen, localisé en Belgique. Les actifs, passifs et résultats opérationnels sont principalement situés en France. 21. Résultat par action Analyse du résultat par action 30 juin 2025 30 juin 2024 Résultat net (en milliers d’euros) (5 383) (21 872) Nombre moyen pondéré d’actions 47 418 47 124 Résultat de base par action (en euros) (0,11) (0,46) Résultat dilué par action (en euros) (0,11) (0,46) Les instruments donnant un accès différé au capital (options sur actions, bons de souscription des fondateurs et bons de souscription) sont considérés comme anti-dilutifs car ils entraînent une diminution de la perte par action. Par conséquent, la perte diluée par action est identique à la perte de base par action, car tous les instruments de capitaux propres émis, représentant un total de 5 158 881 actions ordinaires supplémentaires potentielles, sont considérés comme anti-dilutifs. 22. Engagements Les engagements hors bilan n'ont pas évolué de manière significative depuis le 31 décembre 2024, à l'exception des éléments suivants : Engagements liés au contrat-cadre de services avec Janssen dédié à la fabrication clinique de JNJ-1900 (NBTXR3) Le 22 décembre 2023, la Société a conclu un accord de services cadre (Master Service Agreement ou « MSA ») avec Janssen qui comprend la fabrication clinique et la fourniture de produits par la Société, ainsi que des services d’expertise technique et de développement, tels que définis dans l’Accord Janssen signé en juillet 2023. Au titre de cet accord, au 30 juin 2025, la Société a reçu des bons de commande de Janssen (a) pour la livraison de matières premières et de lots cliniques et techniques de JNJ-1900 (NBTXR3) prévus au cours du second semestre 2025 pour un montant de 6,1 millions d'euros et (b) pour des services de transfert de technologie et d'assistance technique pour un montant de 0,2 million d'euros. 23. Parties liées Rémunération des principaux dirigeants Les rémunérations présentées ci-après, octroyées aux membres du Directoire et du Conseil de Surveillance ont été comptabilisées en charges au cours de la période présentée : (en milliers d'euros) 30 juin 2025 30 juin 2024 Rémunérations, traitements et avantages en nature 1 159 1 120 Paiements fondés sur des actions 1 723 1 517 Rémunération des membres du Conseil de Surveillance 212 86 Total de la rémunération des parties liées 3 094 2 722 Les modalités d’évaluation sont présentées en Note 18 - Paiements fondés sur des actions des états financiers consolidés de la Société pour l’exercice clos au 31 décembre 2024. Page 50 Parties liées Pour le semestre clos le 30 juin 2025, Johnson & Johnson Innovation – JJDC, filiale de Janssen, détenait environ 11,66 % des actions ordinaires en circulation de Nanobiotix. Nanobiotix et Janssen sont parties à l'accord Janssen, le « TSA » et l'« AAA », tels que décrits dans les états financiers consolidés de l'exercice clos le 31 décembre 2024. Par conséquent, Janssen peut être considéré comme une partie liée de Nanobiotix. Au cours du semestre clos le 30 juin 2025, la Société a continué d'accompagner Janssen dans le processus de transition sur la réalisation de l'étude clinique NANORAY-312, et a continué de réaliser des transactions avec Janssen (Voir Note 16 - Produits des activités ordinaires). Les paiements entre les deux sociétés ainsi que les passifs et créances sont les suivants : (en milliers d’euros) Paiements Actifs/(Passifs) Encaissements (Janssen envers Nanobiotix SA) / Créances 7 387 1 837 Paiements (Nanobiotix SA envers Janssen) / Dettes — (7 905) Total 7 387 (6 068) Page 51 24. Événements postérieurs à la clôture Néant. Page 52 III. Attestation du responsable du rapport financier semestriel Page 53 ATTESTATION DU RESPONSABLE DU RAPPORT FINANCIER SEMESTRIEL J’atteste, à ma connaissance, que les comptes consolidés condensés pour le semestre écoulé sont établis conformément aux normes comptables applicables et donnent une image fidèle du patrimoine, de la situation financière et du résultat de la Société et de l’ensemble des entreprises comprises dans la consolidation au 30 juin 2025, et que le rapport semestriel d’activité ci-joint présente un tableau fidèle des évènements importants survenus pendant les six premiers mois de l’exercice, de leur incidence sur les comptes, des principales transactions entre parties liées et qu’il décrit les principaux risques et les principales incertitudes pour les six mois restants de l’exercice. Fait à Paris, le 30 septembre 2025 Laurent LEVY Président du Directoire Page 54 IV. Rapport des commissaires aux comptes sur l’information financière semestrielle Page 55 GRANT THORNTON KPMG SA Membre français de Grant Thornton International Nanobiotix Période du 1er janvier au 30 juin 2025 Rapport des commissaires aux comptes sur l’information financière semestrielle Page 56 GRANT THORNTON KPMG SA Membre français de Grant Thornton International Tour Eqho 29, rue du Pont 2 avenue Gambetta CS 20070 CS 60055 92200 Neuilly-sur-Seine 92066 Paris La Défense Cedex S.A.S. au capital de € 2 297 184 775 726 417 R.C.S. Nanterre 632 013 843 R.C.S. Nanterre Commissaire aux Comptes Commissaire aux Comptes Membre de la compagnie Membre de la compagnie régionale de Versailles et du Centre régionale de Versailles et du Centre Nanobiotix Période du 1er janvier 2025 au 30 juin 2025 Rapport des commissaires aux comptes sur l’information financière semestrielle 2025 Mesdames, Messieurs les actionnaires, En exécution de la mission qui nous a été confiée par votre assemblée générale et en application de l'article L. 451-1-2 III du Code monétaire et financier, nous avons procédé à : Ø l’examen limité des comptes semestriels consolidés résumés de la société Nanobiotix, relatifs à la période du 1er janvier 2025 au 30 juin 2025, tels qu’ils sont joints au présent rapport ; Ø la vérification des informations données dans le rapport semestriel d’activité. Ces comptes semestriels consolidés résumés ont été établis sous la responsabilité du directoire. Il nous appartient, sur la base de notre examen limité, d’exprimer notre conclusion sur ces comptes. Page 57 1. Conclusion sur les comptes 1. Conclusion sur les comptes Nous avons effectué notre examen limité selon les normes d’exercice professionnel applicables en France. Un examen limité consiste essentiellement à s’entretenir avec les membres de la direction en charge des aspects comptables et financiers et à mettre en œuvre des procédures analytiques. Ces travaux sont moins étendus que ceux requis pour un audit effectué selon les normes d’exercice professionnel applicables en France. En conséquence, l’assurance que les comptes, pris dans leur ensemble, ne comportent pas d’anomalies significatives obtenue dans le cadre d’un examen limité est une assurance modérée, moins élevée que celle obtenue dans le cadre d’un audit. Sur la base de notre examen limité, nous n’avons pas relevé d’anomalies significatives de nature à remettre en cause la conformité des comptes semestriels consolidés résumés avec la norme IAS 34- norme du référentiel IFRS tel qu’adopté dans l’Union européenne relative à l’information financière intermédiaire. Sans remettre en cause la conclusion exprimée ci-dessus, nous attirons votre attention sur l’incertitude liée à des événements ou à des circonstances susceptibles de mettre en cause la continuité d’exploitation décrite dans la note continuité d'exploitation de l’annexe des comptes semestriels consolidés résumés. 2. Vérification spécifique 1. Conclusion sur les comptes Nous avons également procédé à la vérification des informations données dans le rapport semestriel d’activité commentant les comptes semestriels consolidés résumés sur lesquels a porté notre examen limité. Nous n’avons pas d’observation à formuler sur leur sincérité et leur concordance avec les comptes semestriels consolidés résumés. Neuilly-sur-Seine et Paris-La Défense, le 30 septembre 2025, Les Commissaires aux Comptes GRANT THORNTON KPMG SA Membre français de Grant Thornton International Virginie Palethorpe Cédric Adens Page 58 |